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tinker优化的问题
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请教tinker大侠们,我使用tinker三个多月,主要是使用minimize优化 而我需要的是限制一些键长键角,做部分优化,我使用的是minimize 1. 在限制优化的时候,是先加限制条件,后优化,还是先优化再限制 2. 如果需要限制键长的话,是使用哪个子程序呢?rattle?shakeup? 3. 我目前是使用rattle,而优化是使用的LBFGS,我的问题是,在LBFGS这个程序中,哪里体现了先前在rattle中的限制呢?对于加限制和没有加限制的原子,并没有区别对待啊?这样所得到的坐标,我认为是全优化的结果啊!!!! |
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piaoma
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