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tinker优化的问题
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请教tinker大侠们，我使用tinker三个多月，主要是使用minimize优化 而我需要的是限制一些键长键角，做部分优化，我使用的是minimize 1. 在限制优化的时候，是先加限制条件，后优化，还是先优化再限制 2. 如果需要限制键长的话，是使用哪个子程序呢？rattle？shakeup？ 3. 我目前是使用rattle，而优化是使用的LBFGS，我的问题是，在LBFGS这个程序中，哪里体现了先前在rattle中的限制呢？对于加限制和没有加限制的原子，并没有区别对待啊？这样所得到的坐标，我认为是全优化的结果啊！！！！ |
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piaoma
木虫 (小有名气)
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