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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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xslhd0808

金虫 (小有名气)

[求助] 甲烷的pgn怎么写

哪位大神知道甲烷的pgn怎么写啊？我现在想调用pgn生成PSF，手里只有蛋白质的pgn，
package require psfgen
topology top_all36_cgenff.rtf
pdbalias residue HIS HSE
pdbalias atom ILE CD1 CD
segment U {pdb 11.pdb}
coordpdb 11.pdb U
guesscoord
writepdb 12.pdb
writepsf 12.psf
但是我觉得pdbalias residue HIS HSE
pdbalias atom ILE CD1 CD
segment U {pdb 11.pdb}
这三行需要改，但是不知道怎么改啊，直接删了的话不行吧。。。。
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1楼 2013-04-14 11:05:40
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liudoudou88

新虫 (初入文坛)
这个问题我也遇到了，有没有人知道啊?好想知道。。。。
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4楼2013-04-14 17:22:03
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xslhd0808

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by uestcat at 2013-04-14 14:44:43
路过，帮顶~

3楼2013-04-14 14:51:05
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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)
请问楼主，这个问题解决了吗？用cgenff如何生成蛋白以外的分子的psf文件？
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5楼2015-12-22 09:51:59
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