应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 甲烷的pgn怎么写
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
51/1返回列表
查看: 525  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

xslhd0808

金虫 (小有名气)

[求助] 甲烷的pgn怎么写

哪位大神知道甲烷的pgn怎么写啊？我现在想调用pgn生成PSF，手里只有蛋白质的pgn，
package require psfgen
topology top_all36_cgenff.rtf
pdbalias residue HIS HSE
pdbalias atom ILE CD1 CD
segment U {pdb 11.pdb}
coordpdb 11.pdb U
guesscoord
writepdb 12.pdb
writepsf 12.psf
但是我觉得pdbalias residue HIS HSE
pdbalias atom ILE CD1 CD
segment U {pdb 11.pdb}
这三行需要改，但是不知道怎么改啊，直接删了的话不行吧。。。。
回复此楼

» 猜你喜欢
...一起讨论，共同提高...
1楼 2013-04-14 11:05:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xslhd0808

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by uestcat at 2013-04-14 14:44:43
路过，帮顶~

3楼2013-04-14 14:51:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

liudoudou88

新虫 (初入文坛)
这个问题我也遇到了，有没有人知道啊?好想知道。。。。
赞一下 回复此楼
4楼2013-04-14 17:22:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)
请问楼主，这个问题解决了吗？用cgenff如何生成蛋白以外的分子的psf文件？
赞一下 回复此楼
5楼2015-12-22 09:51:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 福建理工大学材料学院先进合金团队招收考研调剂学生 +3 大华金商都 2026-03-30 4/200 2026-03-31 01:04 by 方英俊602
[考研] 291求调剂 +8 Y-cap 2026-03-29 11/550 2026-03-30 21:03 by Y-cap
[考研] 279求调剂 +12 j的立方 2026-03-29 12/600 2026-03-30 20:30 by dick_runner
[考研] 一志愿哈尔滨工业大学材料与化工方向336分 +12 辰沐5211314 2026-03-26 12/600 2026-03-30 19:28 by Wang200018
[考研] 322求调剂 +10 宋明欣 2026-03-27 10/500 2026-03-30 18:47 by 544594351
[考研] 317分 一志愿南理工材料工程 本科湖工大 求调剂 +12 芋泥小铃铛 2026-03-28 12/600 2026-03-30 17:06 by wangjy2002
[考研] 0703化学 +14 妮妮ninicgb 2026-03-27 14/700 2026-03-30 12:46 by fangnagu
[考研] 0856求调剂 +8 楒桉 2026-03-28 8/400 2026-03-30 10:00 by wzy-lxz
[考研] 289求调剂 +5 BrightLL 2026-03-29 5/250 2026-03-29 17:24 by zhyzzh
[考研] 一志愿北京理工大学本科211材料工程294求调剂 +8 mikasa的围巾 2026-03-28 8/400 2026-03-29 12:48 by 无际的草原
[考研] 085602 化工专硕 338分 求调剂 +12 路痴小琪 2026-03-27 12/600 2026-03-28 15:41 by L135790
[考研] 复试调剂 +3 raojunqi0129 2026-03-28 3/150 2026-03-28 15:27 by 落睿可思
[考研] 药学105500求调剂 +3 Ssun。。 2026-03-28 3/150 2026-03-28 11:24 by lxf170613
[考研] 求调剂推荐 材料 304 +15 荷包蛋hyj 2026-03-26 15/750 2026-03-28 04:13 by fmesaito
[考研] 266分求材料化工冶金矿业等专业的调剂 +4 哇呼哼呼哼 2026-03-26 4/200 2026-03-27 17:02 by zhyzzh
[考研] 315调剂 +4 0860求调剂 2026-03-26 5/250 2026-03-27 11:23 by wangjy2002
[考研] 一志愿郑大085600，310分求调剂 +5 李潇可 2026-03-26 5/250 2026-03-27 11:14 by 不吃魚的貓
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +4 崔wj 2026-03-26 4/200 2026-03-27 08:04 by chemisry
[考研] 机械学硕总分317求调剂！！！！ +4 Acaciad 2026-03-25 4/200 2026-03-25 19:59 by hanserlol
[考研] 347求调剂 +4 L when 2026-03-25 4/200 2026-03-25 13:37 by cocolv
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭