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贤愚Libra

银虫 (正式写手)

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[交流] 分离根际促生菌、菌株鉴定、聚类分析

问题1.分离根际土壤促生菌设置条件为黑暗中培养3天，这种条件是依据什么设置的？
2.如附件word及图示，聚类分析，该文章表述它有三个分支，但它的分析似乎又只有两个分支，这个聚类图怎么分析啊？
3.仅用blast比对16s，能确定它是什么菌吗？如附件PDF该文章依据其16s相似99%而说这个菌是蜡样芽孢杆菌，这样能行吗？
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1楼 2013-04-14 10:02:37

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zrg1989

铜虫 (小有名气)

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3.仅用blast比对16s，能确定它是什么菌吗？如附件PDF该文章依据其16s相似99%而说这个菌是蜡样芽孢杆菌，这样能行吗？
绝对不行，因为蜡样芽胞杆菌、炭疽芽胞杆菌、苏云金芽孢杆菌是无法用16s区分的，除非再加上生理生化特征。另外，仅用blast比对16s一般能100%确定到属，但不能100%确定到种。你看的文章可能不严谨