应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 自己从日本晴中克隆出来的序列和日本晴基因组数据库中的序列差别很大？
101/1返回列表
查看: 2069  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

zaasyangyong

金虫 (正式写手)

[交流] 自己从日本晴中克隆出来的序列和日本晴基因组数据库中的序列差别很大？ 已有3人参与

自己从日本晴中克隆出来的序列和日本晴基因组数据库中的序列差别很大？，请问大家有无遇到过这种情况？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
算了
1楼 2013-04-10 15:13:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gaoyang636

木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
多大的差异算很大？
能不能贴个结果看看 ：)
赞一下 回复此楼
2楼2013-04-10 17:48:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zaasyangyong

金虫 (正式写手)
一段序列，约3k，从日本晴中分段PCR克隆，去RAP-DB和日本晴基因组比对，惊奇发现差异很大；在NCBI比对，前2个都是野生稻，第3个才是日本晴序列（图1），同源性大都在80%左右（图2，3）。

Blast.JPG



野生稻.JPG



日本晴.JPG
赞一下 回复此楼
算了
3楼2013-04-10 18:19:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zmj521good

铁杆木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
遇到过有差别的，但没有遇到差别很大的
赞一下 回复此楼
认真是一种习惯
4楼2013-04-13 09:23:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zaasyangyong

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by zmj521good at 2013-04-13 09:23:05
遇到过有差别的，但没有遇到差别很大的

相对于9311，日本晴基因组序列堪称完美，据说侧了8遍，我以前只遇到过个别碱基差异。不知道这次是为啥啊？我觉得这应该不是这样的，应该有其他原因。就是想问问大家有谁遇到过类似的？
赞一下 回复此楼
算了
5楼2013-04-13 17:02:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zmj521good

铁杆木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by zaasyangyong at 2013-04-13 17:02:27
相对于9311，日本晴基因组序列堪称完美，据说侧了8遍，我以前只遇到过个别碱基差异。不知道这次是为啥啊？我觉得这应该不是这样的，应该有其他原因。就是想问问大家有谁遇到过类似的？...

我一个同学测序结果直接比NCBI中给出的日本晴测序结果中间多出 了几百bp，多次验证都是这个结果
赞一下 回复此楼
认真是一种习惯
6楼2013-04-15 09:08:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zaasyangyong

金虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by zmj521good at 2013-04-15 09:08:27
我一个同学测序结果直接比NCBI中给出的日本晴测序结果中间多出 了几百bp，多次验证都是这个结果...

多次验证是自己收集的日本晴种子的苗，有无要其他老师的日本晴验证过？
赞一下 回复此楼
算了
7楼2013-04-15 11:21:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zmj521good

铁杆木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by zaasyangyong at 2013-04-15 11:21:57
多次验证是自己收集的日本晴种子的苗，有无要其他老师的日本晴验证过？...

应该没有吧，他好像没有考虑到这点
赞一下 回复此楼
认真是一种习惯
8楼2013-04-16 11:46:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zaasyangyong

金虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by zmj521good at 2013-04-16 11:46:59
应该没有吧，他好像没有考虑到这点...

谢谢！
回复此楼
算了
9楼2013-04-17 14:20:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nicou

金虫 (小有名气)
后来呢？
回复此楼
10楼2019-01-09 11:13:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zaasyangyong 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[有机交流] 伯胺上甲基求助 100+4 002tmumu 2026-07-14 4/200 2026-07-15 22:01 by 学员oN9JQD
[基金申请] H口，面上，时间戳7月7日。 +3 plumage5 2026-07-15 3/150 2026-07-15 21:06 by 6543yes
[基金申请] 小木虫没落了，除了祈祷帖子，几乎看不到有价值的帖子 +13 botar 2026-07-14 14/700 2026-07-15 19:28 by 寒流32
[基金申请] 会评 +5 无名者登山 2026-07-15 5/250 2026-07-15 18:15 by 杠就是你对
[基金申请] 生生命学部会评 +3 wuke100666 2026-07-15 3/150 2026-07-15 17:11 by kingkocxr
[基金申请] E口会评 +11 布布和一二 2026-07-13 13/650 2026-07-15 16:34 by Kittylucky
[基金申请] E口青C会评结束了吗？ 40+3 小小书虫c 2026-07-14 9/450 2026-07-15 16:04 by 安静的知了
[基金申请] 生命口C13面上会评时间 +6 luckinging 2026-07-14 9/450 2026-07-15 14:39 by 雨冰共舞
[教师之家] 内心匮乏 +13 水冰月月野兔 2026-07-12 13/650 2026-07-15 14:21 by jiduquegai
[文学芳草园] 你可曾有过这种感受？ +3 Jeanya 2026-07-09 6/300 2026-07-15 11:07 by mbtwt
[论文投稿] 农业机械学报投稿周期 +3 G0DLIN 2026-07-14 7/350 2026-07-15 09:26 by xs74101122
[基金申请] 国自然面上D口祈祷 +4 monkeynana 2026-07-14 4/200 2026-07-15 09:14 by 白水煮
[论文投稿] 跨出版社商投稿 20+4 倪好520 2026-07-13 4/200 2026-07-15 08:35 by bobvan
[基金申请] 没收到消息，再次陪跑 +3 天空星辰fly 2026-07-14 3/150 2026-07-14 19:14 by 6543yes
[基金申请] 不要再数国自然申请书的 filecode 的分隔符个数了 +13 sadpencil 2026-07-12 20/1000 2026-07-14 13:12 by 杠就是你对
[基金申请] 明天E口面上会评 +8 布布和一二 2026-07-12 9/450 2026-07-13 22:59 by QTSorange
[论文投稿] MSER送审了还被拒稿 +4 S778950906 2026-07-08 6/300 2026-07-13 16:22 by tfang
[基金申请] 祈祷青基必中 50+6 hadengry 2026-07-09 16/800 2026-07-12 20:31 by 登山虫虫
[考博] 27届辽宁大学应届毕业生申博 +3 可乐微风大海 2026-07-09 3/150 2026-07-10 21:23 by 贪玩的研究僧
[基金申请] 关于如何从代码看上不上会 +17 且听虎啸 2026-07-09 23/1150 2026-07-10 19:51 by sdfapple719
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭