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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » DS 结果分析
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古小青

新虫 (初入文坛)

[求助] DS 结果分析

用DS做分子动力学的目的是什么，期望得到什么样的结果？
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1楼 2013-04-01 21:59:03
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wangyan10

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2013-04-06 09:01:53
古小青: 金币+20 2013-04-07 12:30:07
引用回帖:
5楼: Originally posted by 古小青 at 2013-04-04 22:52:01
我就是只会做模拟不会分析，有没有什么比较好的推荐与建议？...

其实这么说吧，可能说的有点不好听，如果只会做模拟而不会做分析，那做模拟就是任何意义都没有了。做模拟就是为了进行详细的数据分析，从而得出一些有用的结论的，否则模拟没有任何意义。如果说一点分析都不会做的话，就先看看一些入门的文献，那上面都会有一些简单基本的分析方法。另外可以看看AMBER网站上的教程，（如果你是用AMBER做的动力学模拟的话）http://ambermd.org/tutorials/basic/tutorial3/section6.htm
希望能帮到你。
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努力的生活着
6楼2013-04-05 16:40:05
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chaizhm

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
古小青: 金币+10, ★有帮助 2013-04-07 12:30:00
你的问题问的相当不清楚，你不能问别人分子动力学能得到什么，你得先问问你为什么要用分子动力学，想得到什么
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壁立万仞，无欲则刚
2楼2013-04-02 08:29:10
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wangyan10

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2013-04-06 09:01:23
DS只是一个软件，而用DS进行分子动力学只是这个软件的功能之一。如果在做动力学模拟之前对所研究的体系没有一个比较全面（或者说比较多的）认识的话，这样做出的动力学模拟还是比较盲目的。
赞一下(1人) 回复此楼
努力的生活着
3楼2013-04-02 09:56:50
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古小青

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by chaizhm at 2013-04-02 08:29:10
你的问题问的相当不清楚，你不能问别人分子动力学能得到什么，你得先问问你为什么要用分子动力学，想得到什么

那为什么要用分子动力学呢，想得到什么呢？
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4楼2013-04-04 22:51:14
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