24小时热门版块排行榜    

查看: 1212  |  回复: 5

zs416

铁虫 (小有名气)

[求助] PCR小白,请教个关于NCBI的问题

PCR小白一枚,不会设计引物,想在NCBI上找个文章中的现成引物。已经在NCBI上找到该基因了,但是,不知道怎么由基因的同源序列那里反过去查文章,请高手们教教我。
回复此楼
实验顺利
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liyu0355

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这个设计需要相关软件的,不知你有没有相关软件呢?
2楼2013-03-30 18:53:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zs416

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by liyu0355 at 2013-03-30 18:53:37
这个设计需要相关软件的,不知你有没有相关软件呢?

下了Primer5.0,但是用的还不熟练。想请问一下,我要用PCR扩增DNA的某个基因的保守序列,前提是我不知道我研究的材料的该基因的序列,如果用Primer5.0设计引物的时候,我是不是该把我在其他物种上查到的该基因的保守序列输入到Primer中呢?
实验顺利
3楼2013-04-01 23:06:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liyu0355

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


zs416(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-05-31 16:54:06
把其他物种上查到的该基因的保守序列输入到Primer中.
设计引物,进行扩增你的目的片段.
4楼2013-04-02 10:50:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

奇怪人生123

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


zs416(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-05-31 16:54:14
多个物种的相似功能基因进行比对,可以是基因序列比对,蛋白比对的话更好。如果是蛋白比对,挑选保守性高的位点设计简并引物,以你的菌种为模板,进行简并PCR。
实时荧光定量PCR(TaqMan探针法)欢迎和大家探讨~
5楼2013-04-02 16:39:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

意孤城_

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-05-31 16:54:20
gyesang: 回帖置顶 2013-05-31 16:54:37
关于引物设计 很多人都选择使用软件什么的 那肯定会很好。从我们实验室来讲 从来不使用(除了一些特殊的PCR外)我们设计引物真的很随意的  就在你的目的基因的上下游随机取上18-20bp的序列(如果是从基因组上扩增就适当在长一点),有需要酶切位点的加上再加上保护碱基(有时候就达到近30bp),有的时候上下游退火温度相差很大,使用梯度或者Touchdown很随意就p出目的条带了,百试不爽。当然可以注意一下3‘末端最后一个碱基避免T
6楼2013-04-02 20:46:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zs416 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 导师吐槽:我怎么摊上了这么个极品研究生! +8 苏东坡二世 2026-08-23 8/400 2026-08-28 14:41 by lkforward
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +4 gdd2018 2026-08-28 9/450 2026-08-28 14:22 by jklily
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 申请删除本帖 +6 lyz123lyz 2026-08-27 7/350 2026-08-27 17:31 by 宁静致远sy
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +9 炎黄贵胄 2026-08-22 10/500 2026-08-26 15:40 by semaglutide
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 国合现在查不到了吗? +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
信息提示
请填处理意见