24小时热门版块排行榜    

查看: 1185  |  回复: 5

zs416

铁虫 (小有名气)

[求助] PCR小白,请教个关于NCBI的问题

PCR小白一枚,不会设计引物,想在NCBI上找个文章中的现成引物。已经在NCBI上找到该基因了,但是,不知道怎么由基因的同源序列那里反过去查文章,请高手们教教我。
回复此楼
实验顺利
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖置顶 ( 共有1个 )

意孤城_

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-05-31 16:54:20
gyesang: 回帖置顶 2013-05-31 16:54:37
关于引物设计 很多人都选择使用软件什么的 那肯定会很好。从我们实验室来讲 从来不使用(除了一些特殊的PCR外)我们设计引物真的很随意的  就在你的目的基因的上下游随机取上18-20bp的序列(如果是从基因组上扩增就适当在长一点),有需要酶切位点的加上再加上保护碱基(有时候就达到近30bp),有的时候上下游退火温度相差很大,使用梯度或者Touchdown很随意就p出目的条带了,百试不爽。当然可以注意一下3‘末端最后一个碱基避免T
6楼2013-04-02 20:46:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

liyu0355

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这个设计需要相关软件的,不知你有没有相关软件呢?
2楼2013-03-30 18:53:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zs416

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by liyu0355 at 2013-03-30 18:53:37
这个设计需要相关软件的,不知你有没有相关软件呢?

下了Primer5.0,但是用的还不熟练。想请问一下,我要用PCR扩增DNA的某个基因的保守序列,前提是我不知道我研究的材料的该基因的序列,如果用Primer5.0设计引物的时候,我是不是该把我在其他物种上查到的该基因的保守序列输入到Primer中呢?
实验顺利
3楼2013-04-01 23:06:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liyu0355

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


zs416(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-05-31 16:54:06
把其他物种上查到的该基因的保守序列输入到Primer中.
设计引物,进行扩增你的目的片段.
4楼2013-04-02 10:50:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

奇怪人生123

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


zs416(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-05-31 16:54:14
多个物种的相似功能基因进行比对,可以是基因序列比对,蛋白比对的话更好。如果是蛋白比对,挑选保守性高的位点设计简并引物,以你的菌种为模板,进行简并PCR。
实时荧光定量PCR(TaqMan探针法)欢迎和大家探讨~
5楼2013-04-02 16:39:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zs416 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +12 koalala 2026-08-24 14/700 2026-08-24 12:41 by S09300097
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +17 羊腰板 2026-08-21 18/900 2026-08-24 12:03 by iaeyuan
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +6 炎黄贵胄 2026-08-22 7/350 2026-08-24 11:58 by 6543yes
[基金申请] 朋友圈看到的 +7 wangzilk 2026-08-18 9/450 2026-08-24 10:50 by cmrandy
[基金申请] 让我中一个面上吧! +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[基金申请] 明天应该可查了!? +4 chengyan1220 2026-08-23 4/200 2026-08-24 08:47 by gloomy6159
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +7 且听虎啸 2026-08-17 8/400 2026-08-22 21:55 by 医学老男孩
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +24 yaoyewhu2008 2026-08-20 26/1300 2026-08-22 17:43 by kammury
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +13 ziyangfang 2026-08-19 16/800 2026-08-22 17:08 by WH3796
[基金申请] 人气不行了 +8 fansofjerry 2026-08-21 8/400 2026-08-22 16:30 by zyqchem
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 我面上完蛋了 +7 且听虎啸 2026-08-20 8/400 2026-08-21 12:31 by 酷酷墨镜
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[论文投稿] 投稿咨询 +5 wwm09 2026-08-17 7/350 2026-08-21 10:11 by 期刊论文帮手
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
请填处理意见