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fayzhao

金虫 (小有名气)

[求助] 摇菌 不浑浊 已有1人参与

各位好,
目前我正在做的是构建表达载体,我做的是线虫RNAi。

具体步骤是这样的:
双酶切得到正确的目的基因片段,连接到L4440载体,转化到大肠杆菌HT115中,挑单克隆测序,将阳性克隆菌液保存。

遇到的问题是这样的:
首先说明一下LB培养基没有问题(因为同时摇的还有其他菌,且浑浊)。
测序正确的菌液无法摇浑浊。接着我将菌液涂平板以复壮,但是挑到的单菌落还是无法摇浑浊。接下来我将最初转化时涂的平板拿出来(已在4℃保存一周),挑取上面的单菌落摇菌,仍然不能摇浑。

我实在是找不到原因了,无奈啊,希望知道方法的同道帮帮忙啊,O(∩_∩)O谢谢啦
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tuodecai

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
fayzhao: 金币+4 2013-03-21 09:17:48
引用回帖:
13楼: Originally posted by fayzhao at 2013-03-20 16:33:11
可是我第一次挑菌之后摇6小时就浑浊了呀,还测序测出来了呢,应该不会有毒性吧。后来摇菌都是摇12~16小时,都不浑浊。我打算再做一遍……

并且菌液放在4℃冰箱里应该不会死吧,但是后来看摇菌和涂平板的情况,感 ...

其实我也遇到过跟你一样觉得很巧的事儿,我就有一次构建出的差不多插入10kb的病毒序列载体,刚开始鉴定出来的菌提质粒特别高可达到1ug/ul以上,可后来菌放了一段时间,连我-80度保存的甘油管拿出来再摇菌再也没那效果了,基本上都是50ng/ul不到。其实对于正常的菌在4度或-80度存放过的,菌的活力都会下降,一般都会先来个活化的过程。但对不太稳定的菌来说,那就更是如此了。一般菌液在4度放个一个月左右都还是有活性的,就像你说的时间不是很长的话,活力下降得很多,可见你的质粒确实不太稳定。哦,你好像是说,你构的是RNAi干扰载体吧?若是这样,你的插入序列有反向重复序列吧,若是这样,不稳定的可能性就更大了。你可以试着重新构好,转化看看效果。就知道是不你的载体导致的菌的不稳定。若排除常见的小问题,我觉得这种情况比较大!
16楼2013-03-20 23:30:42
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无为书生

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
fayzhao: 金币+1 2013-03-19 18:12:24
考虑过抗性的问题没?会不会是抗生素搞错了。挑单菌落时尽量养肥一点,只要没有卫星菌落就行,要确保挑到了菌!
2楼2013-03-19 16:45:12
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lijuan211715

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
fayzhao: 金币+1 2013-03-19 18:13:08
是不是你要表达的对宿主菌有毒性啊
3楼2013-03-19 17:23:17
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fayzhao

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 无为书生 at 2013-03-19 16:45:12
考虑过抗性的问题没?会不会是抗生素搞错了。挑单菌落时尽量养肥一点,只要没有卫星菌落就行,要确保挑到了菌!

抗生素没有错,一直都是那样用的,换了两次培养基了,都是摇不浑浊……
4楼2013-03-19 18:13:03
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