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zhouzhiguang

金虫 (小有名气)

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[求助] DS跑完MD后RMSD的reference问题

DS跑完MD后，要做RMSD vs time的轨迹曲线，RMSD应该是取第一帧（即heating的第一帧），还是应该取production的第一帧。
按道理我觉得应该取production的第一帧，毕竟应该是取平衡后的产物来分析RMSD才妥的。
但是就是好多文献上对MD的结果分析中都是RMSD从时间0开始算起，是不是需要把轨迹的值重新提出来，导入excel或者origin重新作图的啊？
请大神帮忙。谢谢

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