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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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zhouzhiguang

金虫 (小有名气)

[求助] DS跑完MD后RMSD的reference问题

DS跑完MD后,要做RMSD vs time的轨迹曲线,RMSD应该是取第一帧(即heating的第一帧),还是应该取production的第一帧。
按道理我觉得应该取production的第一帧,毕竟应该是取平衡后的产物来分析RMSD才妥的。
但是就是好多文献上对MD的结果分析中都是RMSD从时间0开始算起,是不是需要把轨迹的值重新提出来,导入excel或者origin重新作图的啊?
请大神帮忙。谢谢
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arthurii

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
一般0ns就是指production的开始。
2楼2013-03-20 15:41:17
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