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lstone03木虫 (小有名气)
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linux下gauss运行错误
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Sample Text自己在linux下安装了gauss03E01，但是运行时出现了问题： lstone@Lstone:~/g03/scratch$ g03 test.gjf forrtl: No such file or directory forrtl: severe (29): file not found, unit 11, file /tmp/lstone/g03/Gau-3525.inp Image PC Routine Line Source g03 00000000004AED6E Unknown Unknown Unknown g03 00000000004ADF6A Unknown Unknown Unknown g03 00000000004446AA Unknown Unknown Unknown g03 0000000000418E6A Unknown Unknown Unknown g03 0000000000418476 Unknown Unknown Unknown g03 000000000042BB8E Unknown Unknown Unknown g03 0000000000405C29 Unknown Unknown Unknown g03 0000000000404C02 Unknown Unknown Unknown libc.so.6 00007F39F75CD76D Unknown Unknown Unknown g03 0000000000404B29 Unknown Unknown Unknown 而且也出现了test.log 文件，但是文件里面只有三行话： Entering Gaussian System, Link 0=g03 Input=test.gjf Output=test.log 不知道这是怎么回事，对linux不大懂，自己按照网上的教程装gauss，之前遇到问题在网上查了还能解决，但是这个问题我是不知道该怎么办了，在网上看了说要改文件的权限，我试过了但是没有用，还请高人指点，非常感谢！ |
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2楼2013-03-13 22:32:36
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嗯，在自己电脑上装了一个双系统，然后就用按网上的方法装gauss了。 我路径设置就是按网上设置的 # for Gaussian.03.C02 G03ROOT=/home/lstone/g03 GAUSS_EXEDIR=$G03ROOT GAUSS_SCRDIR=/tmp/lstone/g03 LD_LIBRARY_PATH=$G03ROOT/:$LD_LIBRARY_PATH PATH=$G03ROOT/:$PATH export G03ROOT GAUSS_EXEDIR GAUSS_SCRDIR LD_LIBRARY_PATH PATH 也不知道到底是哪里出了问题，还请版主指教。 |
3楼2013-03-13 22:38:52
gmy1990
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6楼2013-03-14 06:40:56
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我现在把路径改了，没有这个错误了，但是又出现了新的错误。。。 lstone@Lstone:~$ cd /home/lstone/g03/scratch lstone@Lstone:~/g03/scratch$ g03 test.gjf ntrext1: Bad file descriptor Aborted (core dumped) 然后看程序的。out文件，发现如下： Entering Gaussian System, Link 0=g03 Input=test.gjf Output=test.log Initial command: /home/lstone/g03/l1.exe /home/lstone/g03/scratch/Gau-2769.inp -scrdir=/home/lstone/g03/scratch/ Entering Link 1 = /home/lstone/g03/l1.exe PID= 2771. ****************************************** Gaussian 03: EM64T-G03RevE.01 11-Sep-2007 14-Mar-2013 ****************************************** %chk=C:\Users\Lstone\Documents\Gauss\Reaction Pathway\hypothesis1\Untitled-1.chk ntrext1 也不知道这是怎么回事 http://muchong.com/html/201012/2664626.html 我试过用这个帖子里面的方法，但是没有用，还请大家指教！ |
7楼2013-03-14 09:39:40
pwzhou
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【答案】应助回帖
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lstone03: 金币+20, ★★★很有帮助, 谢谢你了，我好像明白我刚刚遇到的错误了，我发现我从网上下的gauss里面居然没有l202文件。。。 2013-03-14 12:34:17
ben_ladeng: 金币+2, 谢谢 2013-03-25 20:37:45
lstone03: 金币+20, ★★★很有帮助, 谢谢你了，我好像明白我刚刚遇到的错误了，我发现我从网上下的gauss里面居然没有l202文件。。。 2013-03-14 12:34:17
ben_ladeng: 金币+2, 谢谢 2013-03-25 20:37:45
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%chk=C:\Users\Lstone\Documents\Gauss\Reaction Pathway\hypothesis1\Untitled-1.chk 你这样的check文件Linux如何建立啊？改成： %chk=Untitled-1.chk 试试。 |
8楼2013-03-14 11:13:08
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这样改过之后确实可以运行，但是后面接着遇到了问题。。。 lstone@Lstone:~$ cd /home/lstone/g03/scratch lstone@Lstone:~/g03/scratch$ g03 test.gjf No executable for file l202.exe. Search path GAUSS_EXEDIR is "/home/lstone/g03" : No such file or directory Aborted (core dumped) 然后我的输出文件如下： ****************************************** Gaussian 03: EM64T-G03RevE.01 11-Sep-2007 14-Mar-2013 ****************************************** %chk=Untitled-1.chk ------------------------------------- # freq rb3lyp/6-31g geom=connectivity ------------------------------------- 1/10=4,30=1,38=1,57=2/1,3; 2/17=6,18=5,40=1/2; 3/5=1,6=6,11=2,16=1,25=1,30=1,74=-5/1,2,3; 4/7=1/1; 5/5=2,38=5/2; 8/6=4,10=90,11=11/1; 11/6=1,8=1,9=11,15=111,16=1/1,2,10; 10/6=1/2; 6/7=2,8=2,9=2,10=2,18=1,28=1/1; 7/8=1,10=1,25=1/1,2,3,16; 1/10=4,30=1/3; 99//99; ---------- Untitled-1 ---------- Symbolic Z-matrix: Charge = 0 Multiplicity = 1 C -1.51128 0.15049 0.23206 C -0.09795 0.25233 -0.29948 C 0.8159 -0.82617 0.30702 O -2.33612 -0.66507 -0.19298 O 2.16504 -0.65012 -0.16814 O 0.5086 1.51708 0.10488 H -1.74569 0.8424 1.06162 H -0.09727 0.1383 -1.39069 H 0.48768 -1.81559 -0.01335 H 0.76622 -0.76731 1.40332 H 2.42524 0.2761 0.02441 H 0.22355 2.25107 -0.47289 GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad Berny optimization. Initialization pass. Trust Radius=3.00D-01 FncErr=1.00D-07 GrdErr=1.00D-07 Number of steps in this run= 2 maximum allowed number of steps= 2. GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad No executable for file l202.exe. Search path GAUSS_EXEDIR is "/home/lstone/g03" 我的.bashrc文件是如下设置： # for Gaussian03E01 G03ROOT=/home/lstone/g03 GAUSS_EXEDIR=$G03ROOT GAUSS_SCRDIR=/home/lstone/g03/scratch LD_LIBRARY_PATH=$G03ROOT/:$LD_LIBRARY_PATH PATH=$G03ROOT/:$PATH export G03ROOT GAUSS_EXEDIR GAUSS_SCRDIR LD_LIBRARY_PATH PATH 还请指教，非常感谢！ |
9楼2013-03-14 12:04:49
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