应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » QE(Pwscf) » pwscf运算过程中遇到的CRASH，求解决
101/1返回列表
查看: 1630  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

骑英奔腾

铜虫 (小有名气)

[求助] pwscf运算过程中遇到的CRASH，求解决

我在计算过程中遇到这种CRASH的情况：
problems computing cholesky decomposition
请问这是什么回事
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

pwscf

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-03-13 08:50:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gemucai

木虫 (正式写手)
原子挨得太近了，用XCRYSDEN检查一下
赞一下 回复此楼
2楼2013-03-13 10:03:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

骑英奔腾

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by gemucai at 2013-03-13 10:03:15
原子挨得太近了，用XCRYSDEN检查一下

XCRYSDEN怎么检查出挨得太近，太远我知道会不成键。谢谢
赞一下 回复此楼
3楼2013-03-13 13:23:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gemucai

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 骑英奔腾 at 2013-03-13 13:23:51
XCRYSDEN怎么检查出挨得太近，太远我知道会不成键。谢谢...

一般出现problems computing cholesky decomposition是因为在优化过程中原子挨得太近，参见http://qe-forge.org/pipermail/pw_forum/2008-September/084655.html
当然，如果是赝势的问题就另当别论。还有，能给出输入文件吗？
赞一下 回复此楼
4楼2013-03-13 14:28:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

骑英奔腾

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by gemucai at 2013-03-13 14:28:00
一般出现problems computing cholesky decomposition是因为在优化过程中原子挨得太近，参见http://qe-forge.org/pipermail/pw_forum/2008-September/084655.html
当然，如果是赝势的问题就另当别论。还有，能给出 ...

&control
    prefix='SCH3',
    calculation = "relax",
    restart_mode='from_scratch',
    pseudo_dir='/lustre/chengdj/pseudo',
    outdir='/lustre/chengdj/tmp',
/
&system   
    ibrav=0,
    nat=5,
    ntyp=3,
    ecutwfc = 40,
    ecutrho = 400,
    occupations='smearing',
    smearing='marzari-vanderbilt',
    degauss=0.002,
    nspin = 2,  
    starting_magnetization(1)=0.7,
    starting_magnetization(2)=0.7,
    starting_magnetization(3)=0.7,
/
&electrons
    conv_thr = 1.0e-6,
    mixing_mode='local-TF',
    mixing_beta = 0.1D0,
/
&IONS
  bfgs_ndim         = 3,
  pot_extrapolation = "second_order",
  wfc_extrapolation = "second_order",
/
CELL_PARAMETERS cubic
30.0  0.0  0.0
0.0 30.0  0.0
0.0  0.0 30.0
ATOMIC_SPECIES
C  12.010 C.pbe-rrkjus.UPF
S  32.070 S.pbe-van_bm.UPF
H  1.000  H.pbe-rrkjus.UPF
ATOMIC_POSITIONS angstrom
S        -1.79658497   1.27674743   .19925346
C        -.29557826    2.28143816    .31619436
H        -.48257659   3.16433075     1.01270872
H        .55603565   1.64569857      .72873392
H        -.01480890   2.66707342   -.71920603
K_POINTS gamma
赞一下 回复此楼
5楼2013-03-13 18:56:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gemucai

木虫 (正式写手)
兄弟，我为什么就没报错呢，刚才算完了。。。
赞一下 回复此楼
6楼2013-03-14 10:50:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gemucai

木虫 (正式写手)
我最后优化出的结果是：
ATOMIC_POSITIONS (angstrom)
S       -1.789256032   1.296127205   0.176953214
C       -0.293208056   2.267175195   0.344084701
H       -0.463279038   3.153330828   0.976468398
H        0.561064900   1.677053597   0.710068139
H       -0.048834845   2.641601504  -0.669890021
赞一下 回复此楼
7楼2013-03-14 14:46:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

骑英奔腾

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by gemucai at 2013-03-14 14:46:49
我最后优化出的结果是：
ATOMIC_POSITIONS (angstrom)
S       -1.789256032   1.296127205   0.176953214
C       -0.293208056   2.267175195   0.344084701
H       -0.463279038   3.153330828   0.9764683 ...

谢谢你，我也算完了，没问题
赞一下 回复此楼
8楼2013-03-15 10:19:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

骑英奔腾

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by gemucai at 2013-03-14 14:46:49
我最后优化出的结果是：
ATOMIC_POSITIONS (angstrom)
S       -1.789256032   1.296127205   0.176953214
C       -0.293208056   2.267175195   0.344084701
H       -0.463279038   3.153330828   0.9764683 ...

顺便问一下，能量算了多少
赞一下 回复此楼
9楼2013-03-15 10:20:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gemucai

木虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 骑英奔腾 at 2013-03-15 10:20:07
顺便问一下，能量算了多少...

输出文件我昨天晚上已经删掉了。。。
赞一下 回复此楼
10楼2013-03-15 10:30:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 骑英奔腾 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 070300化学学硕求调剂 +5 太想进步了0608 2026-03-16 5/250 2026-03-16 14:11 by xwxstudy
[考研] 本人考085602 化学工程 专硕 +9 不知道叫什么！ 2026-03-15 10/500 2026-03-16 10:04 by houyaoxu
[考研] 东南大学364求调剂 +4 JasonYuiui 2026-03-15 4/200 2026-03-16 08:36 by Linda Hu
[考研] 085600材料与化工 求调剂 +12 enenenhui 2026-03-13 13/650 2026-03-16 08:30 by Linda Hu
[考研] 211本，11408一志愿中科院277分，曾在中科院自动化所实习 +3 Losir 2026-03-12 3/150 2026-03-14 12:11 by 热情沙漠
[考研] 学硕285求调剂 +13 Wisjxn 2026-03-12 46/2300 2026-03-14 10:33 by JourneyLucky
[考研] 一志愿郑大070303，338分，求调剂 +4 dadawaf 2026-03-10 5/250 2026-03-14 01:20 by lsw010101
[考研] 招收0805（材料）调剂 +3 18595523086 2026-03-13 3/150 2026-03-14 00:33 by 123%、
[考研] 308求调剂 +3 是Lupa啊 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:30 by JourneyLucky
[考研] 一志愿湖师大化学289求调剂 +6 XMCMM3.14159 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:28 by JourneyLucky
[考研] b区环境工程求调剂 +4 Maps1 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:23 by JourneyLucky
[考研] 0805，333求调剂 +3 112253525 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:42 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工（0856）304求B区调剂 +6 邱gl 2026-03-12 7/350 2026-03-13 23:24 by 邱gl
[硕博家园] 085600 260分求调剂 +3 天空还下雨么 2026-03-13 5/250 2026-03-13 18:46 by 天空还下雨么
[考研] 求b区学校调剂 +3 周56 2026-03-11 3/150 2026-03-13 16:20 by JourneyLucky
[考研] 考研调剂 +4 芬达46 2026-03-12 4/200 2026-03-13 16:04 by ruiyingmiao
[考研] 求调剂 资源与环境 285 +3 未名考生 2026-03-10 3/150 2026-03-13 10:31 by houyaoxu
[考研] 工科0856专硕化学工程269能调剂吗 +10 我想读研11 2026-03-10 10/500 2026-03-13 10:14 by Yuyi.
[考博] 福州大学杨黄浩课题组招收2026年专业学位博士研究生，2026.03.20截止 +3 Xiangyu_ou 2026-03-12 3/150 2026-03-13 09:36 by duanwu655
[考研] 283求调剂，材料、化工皆可 +8 苏打水7777 2026-03-11 10/500 2026-03-13 09:06 by Linda Hu
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭