24小时热门版块排行榜    

查看: 557  |  回复: 0

zxl102623

银虫 (正式写手)

[求助] ligplot-windows 求助

Sample Text

大家好,我在amber中用命令ambpdb -p *.top <*.crd>a.pdb得到一个pdb,想用ligplot进行分析,但是我在windows下:ligplot a.pdb 480 480 (480为ligand的编号),屏幕上没有任何的出错信息,怎么回事:
我看了帖子,很多人说是pdb的问题,但是我怎么没找出来呢?大家帮忙看一下吧:

。。。。。。。。。。。
ATOM   7543 HD21 LEU   479      70.762  64.735  53.659  1.00  0.00           H  
ATOM   7544 HD22 LEU   479      71.585  66.243  53.286  1.00  0.00           H  
ATOM   7545 HD23 LEU   479      70.676  66.085  54.803  1.00  0.00           H  
ATOM   7546  C   LEU   479      68.622  63.345  53.415  1.00  0.00           C  
ATOM   7547  O   LEU   479      69.190  62.953  52.380  1.00  0.00           O  
ATOM   7548  OXT LEU   479      68.783  62.858  54.559  1.00  0.00           O1-
ATOM   7549  Br1 MOL   480      86.973  63.542  86.549  1.00  0.00           B  
ATOM   7550  C12 MOL   480      87.665  64.376  84.989  1.00  0.00           C  
ATOM   7551  C5  MOL   480      88.870  63.901  84.481  1.00  0.00           C  
ATOM   7552  H6  MOL   480      89.396  63.096  84.990  1.00  0.00           H  
ATOM   7553  C4  MOL   480      89.411  64.448  83.323  1.00  0.00           C  
ATOM   7554  O2  MOL   480      90.636  63.944  82.926  1.00  0.00           O  
ATOM   7555  C13 MOL   480      91.390  64.353  81.762  1.00  0.00           C  
ATOM   7556  F4  MOL   480      90.723  64.084  80.626  1.00  0.00           F  
ATOM   7557  F5  MOL   480      91.663  65.669  81.781  1.00  0.00           F  
ATOM   7558  F6  MOL   480      92.561  63.702  81.708  1.00  0.00           F  
ATOM   7559  C3  MOL   480      88.710  65.447  82.638  1.00  0.00           C  
ATOM   7560  H2  MOL   480      89.097  65.877  81.719  1.00  0.00           H  
ATOM   7561  C2  MOL   480      87.488  65.907  83.134  1.00  0.00           C  
ATOM   7562  Br2 MOL   480      86.538  67.221  82.141  1.00  0.00           B  
ATOM   7563  C6  MOL   480      86.966  65.396  84.326  1.00  0.00           C  
ATOM   7564  N1  MOL   480      85.731  65.867  84.863  1.00  0.00           N  
ATOM   7565  H1  MOL   480      84.949  65.252  84.759  1.00  0.00           H  
ATOM   7566  C1  MOL   480      85.622  66.976  85.611  1.00  0.00           C  
ATOM   7567  O1  MOL   480      86.558  67.744  85.683  1.00  0.00           O  
ATOM   7568  C7  MOL   480      84.349  67.239  86.296  1.00  0.00           C  
ATOM   7569  C8  MOL   480      83.132  66.578  86.328  1.00  0.00           C  
ATOM   7570  C10 MOL   480      82.764  65.340  85.515  1.00  0.00           C  
ATOM   7571  F1  MOL   480      83.052  65.459  84.208  1.00  0.00           F  
ATOM   7572  F2  MOL   480      81.448  65.072  85.574  1.00  0.00           F  
ATOM   7573  F3  MOL   480      83.409  64.241  85.947  1.00  0.00           F  
ATOM   7574  N2  MOL   480      82.225  67.129  87.239  1.00  0.00           N  
ATOM   7575  C9  MOL   480      82.763  68.171  87.878  1.00  0.00           C  
ATOM   7576  C11 MOL   480      82.087  68.940  88.966  1.00  0.00           C  
ATOM   7577  H3  MOL   480      81.692  68.259  89.720  1.00  0.00           H  
ATOM   7578  H4  MOL   480      82.788  69.614  89.464  1.00  0.00           H  
ATOM   7579  H5  MOL   480      81.274  69.545  88.566  1.00  0.00           H  
ATOM   7580  S1  MOL   480      84.355  68.557  87.386  1.00  0.00           S  
END
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

智能机器人

Robot (super robot)

我们都爱小木虫

相关版块跳转 我要订阅楼主 zxl102623 的主题更新
信息提示
请填处理意见