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zxl102623银虫 (正式写手)
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[求助]
ligplot-windows 求助
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Sample Text 大家好，我在amber中用命令ambpdb -p *.top <*.crd>a.pdb得到一个pdb，想用ligplot进行分析，但是我在windows下：ligplot a.pdb 480 480 (480为ligand的编号)，屏幕上没有任何的出错信息，怎么回事： 我看了帖子，很多人说是pdb的问题，但是我怎么没找出来呢？大家帮忙看一下吧： 。。。。。。。。。。。 ATOM 7543 HD21 LEU 479 70.762 64.735 53.659 1.00 0.00 H ATOM 7544 HD22 LEU 479 71.585 66.243 53.286 1.00 0.00 H ATOM 7545 HD23 LEU 479 70.676 66.085 54.803 1.00 0.00 H ATOM 7546 C LEU 479 68.622 63.345 53.415 1.00 0.00 C ATOM 7547 O LEU 479 69.190 62.953 52.380 1.00 0.00 O ATOM 7548 OXT LEU 479 68.783 62.858 54.559 1.00 0.00 O1- ATOM 7549 Br1 MOL 480 86.973 63.542 86.549 1.00 0.00 B ATOM 7550 C12 MOL 480 87.665 64.376 84.989 1.00 0.00 C ATOM 7551 C5 MOL 480 88.870 63.901 84.481 1.00 0.00 C ATOM 7552 H6 MOL 480 89.396 63.096 84.990 1.00 0.00 H ATOM 7553 C4 MOL 480 89.411 64.448 83.323 1.00 0.00 C ATOM 7554 O2 MOL 480 90.636 63.944 82.926 1.00 0.00 O ATOM 7555 C13 MOL 480 91.390 64.353 81.762 1.00 0.00 C ATOM 7556 F4 MOL 480 90.723 64.084 80.626 1.00 0.00 F ATOM 7557 F5 MOL 480 91.663 65.669 81.781 1.00 0.00 F ATOM 7558 F6 MOL 480 92.561 63.702 81.708 1.00 0.00 F ATOM 7559 C3 MOL 480 88.710 65.447 82.638 1.00 0.00 C ATOM 7560 H2 MOL 480 89.097 65.877 81.719 1.00 0.00 H ATOM 7561 C2 MOL 480 87.488 65.907 83.134 1.00 0.00 C ATOM 7562 Br2 MOL 480 86.538 67.221 82.141 1.00 0.00 B ATOM 7563 C6 MOL 480 86.966 65.396 84.326 1.00 0.00 C ATOM 7564 N1 MOL 480 85.731 65.867 84.863 1.00 0.00 N ATOM 7565 H1 MOL 480 84.949 65.252 84.759 1.00 0.00 H ATOM 7566 C1 MOL 480 85.622 66.976 85.611 1.00 0.00 C ATOM 7567 O1 MOL 480 86.558 67.744 85.683 1.00 0.00 O ATOM 7568 C7 MOL 480 84.349 67.239 86.296 1.00 0.00 C ATOM 7569 C8 MOL 480 83.132 66.578 86.328 1.00 0.00 C ATOM 7570 C10 MOL 480 82.764 65.340 85.515 1.00 0.00 C ATOM 7571 F1 MOL 480 83.052 65.459 84.208 1.00 0.00 F ATOM 7572 F2 MOL 480 81.448 65.072 85.574 1.00 0.00 F ATOM 7573 F3 MOL 480 83.409 64.241 85.947 1.00 0.00 F ATOM 7574 N2 MOL 480 82.225 67.129 87.239 1.00 0.00 N ATOM 7575 C9 MOL 480 82.763 68.171 87.878 1.00 0.00 C ATOM 7576 C11 MOL 480 82.087 68.940 88.966 1.00 0.00 C ATOM 7577 H3 MOL 480 81.692 68.259 89.720 1.00 0.00 H ATOM 7578 H4 MOL 480 82.788 69.614 89.464 1.00 0.00 H ATOM 7579 H5 MOL 480 81.274 69.545 88.566 1.00 0.00 H ATOM 7580 S1 MOL 480 84.355 68.557 87.386 1.00 0.00 S END |
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