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finesand

铜虫 (小有名气)

[求助] 如何找到cytb全序列

是这样的，我用通用引物对总DNA提取物进行PCR一次，PCR电泳结果显示长度大约在1200bp左右，经华大基因公司双向测序，通测，获得1191bp的序列，但是我测的是Cytb全序列应该是1143bp才对，这接下来我应该怎样从1191bp的序列中获得我要的1143bp的cytb全序列呢？
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1楼 2013-03-08 09:29:14
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lhs521521

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
看一下质粒图谱，找到酶切位点，双酶切再电泳分离！
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寻找真正的自我！
2楼2013-03-08 09:41:25
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finesand

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lhs521521 at 2013-03-08 09:41:25
看一下质粒图谱，找到酶切位点，双酶切再电泳分离！

我做的是鸟类线粒体的Cytb基因，用的是鸟类线粒体基因的通用引物，请问质粒图谱用在这种情况合适吗？电泳分离？那分离后是不是还要测序呢？如果我将获得的1191bp做blast与已知序列比对，把前后的部分切掉这样可行吗？
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3楼2013-03-08 13:24:20
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lhs521521

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by finesand at 2013-03-08 13:24:20
我做的是鸟类线粒体的Cytb基因，用的是鸟类线粒体基因的通用引物，请问质粒图谱用在这种情况合适吗？电泳分离？那分离后是不是还要测序呢？如果我将获得的1191bp做blast与已知序列比对，把前后的部分切掉这样可行吗 ...

哦，你没说清楚，我也误会了，我以为是在载体上连着呢，那样的话你的办法可行！不过我觉得你根据测序的结果找到ATG和TAA类似的起始或终止密码子不就可以确定了吗！
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寻找真正的自我！
4楼2013-03-08 16:35:08
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