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学术问题

银虫 (小有名气)

[求助] 抑制性差减杂交结果分析 急 急!!

两次PCR末端补平两轮差减后的eDNA群体,用与接头外侧序列对应
的一对巢式引物进行PCR扩增。PCR反应中,a和d型分子缺乏引物结合位点而得
不到扩增;c型分子只在一端具有引物结合位点,所以得到线形扩增;b型分子两端
具对称接头,在PCR反应的复性过程中,长的末端反向重复序列容易分子内自我复
性形成“锅一柄”结构,阻抑了这种非特异性扩增,此即抑制PCR作用(Siebertet
a1.,1995)。两端具不同接头的e类分子得到指数级扩

怎么就a d缺乏引物结合位点了 怎么就不能扩增了。还有b怎么就自我复制了   实在不明白了 求解????????

裁剪.jpg



[ Last edited by 学术问题 on 2013-3-5 at 21:22 ]
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微生物小硕
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vergilback

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 学术问题 at 2013-09-22 16:06:12
这么说 d 我明白了,没有接头没有引物结合位点 所以不能扩增。。但是a怎么不能扩增呢?PCR 单链不可以扩增??a  和 c 有什么区别,a 加上一对引物后,第一个循环后,不就是c 了吗?再说了 c只有一个引物结合位点点 ...

兄弟 我也有跟你一样的问题。。你现在搞懂了没。。
我也是觉得a作为单链本身有接头,应该是可以线性扩增的
4楼2017-10-05 17:33:58
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随波逐刘

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
kx444555: 金币+4, 鼓励交流 2013-09-20 20:10:54
先说a:PCR单链无法扩增
d:无接头,而引物结合位点在接头上,引物结合不上,怎么扩增?
b:PCR退火时,指的是引物与载体的结合,其实就是碱基互补配对,而链内退火速度是远远快于链间退火的,接头是反向互补的,退火时容易自身互补,引物就连不上了,抑制性
c:单向接头,只能线性扩增,循环30次的话,扩增30次,而e可以扩增2的30次方(理论上)
经过第一轮PCR,可以使非差异片段比例降低,但还是有,同时,差异片段浓度往往不高,一般循环27次电泳不是很明显,所以得经过缫丝PCR,可以明显富集差异基因了。。。
2楼2013-09-17 00:04:59
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学术问题

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 随波逐刘 at 2013-09-17 00:04:59
先说a:PCR单链无法扩增
d:无接头,而引物结合位点在接头上,引物结合不上,怎么扩增?
b:PCR退火时,指的是引物与载体的结合,其实就是碱基互补配对,而链内退火速度是远远快于链间退火的,接头是反向互补的, ...

这么说 d 我明白了,没有接头没有引物结合位点 所以不能扩增。。但是a怎么不能扩增呢?PCR 单链不可以扩增??a  和 c 有什么区别,a 加上一对引物后,第一个循环后,不就是c 了吗?再说了 c只有一个引物结合位点点,只能把那个 没有接头的扩增啊,只能扩增其中的一条单链啊。。 求解???
微生物小硕
3楼2013-09-22 16:06:12
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