24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 313  |  回复: 2

林祎

木虫 (正式写手)

[求助] 出现这种问题怎么解决

这个蛋白的PDB ID是1N78,在VMD中显示出现两个一模一样的结构,我想在VMD中只展示一个,这个怎么操作?

2013-03-04_182047.png
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

VMD 软件

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
林祎: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2013-03-04 21:16:08
推荐你去了解一下PDB 文件的格式以及VMD 的atomselect命令
个人感觉学习 VMD 对分子动力学模拟很重要,具体方法:
如果仅仅是显示的话,这样


如果想分离其中的一个,可以使用下面的脚本
mol load pdb 1N78.pdb
set sel [atomselect top "chain A C "]
$sel writepdb ok.pdb[ Last edited by jiaoyixiong on 2013-3-4 at 21:08 ]

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : ok.pdb
  • 2013-03-04 21:07:47, 455.23 K
2楼2013-03-04 21:06:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

林祎

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2013-03-04 21:06:15
推荐你去了解一下PDB 文件的格式以及VMD 的atomselect命令
个人感觉学习 VMD 对分子动力学模拟很重要,具体方法:
如果仅仅是显示的话,这样


如果想分离其中的一个,可以使用下面的脚本
mol load pdb 1N78. ...

谢谢啦
3楼2013-03-04 21:16:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 林祎 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料与化工306分找调剂 +12 沧海轻舟e 2026-04-03 13/650 2026-04-04 23:45 by lqwchd
[考研] 288环境专硕,求调材料方向 +13 lllllos 2026-04-04 14/700 2026-04-04 23:34 by lqwchd
[考研] 一志愿南航,数一英一学硕317求调剂!! +3 Acaciad 2026-04-04 3/150 2026-04-04 22:29 by lbsjt
[考研] 环境285分,过六级,求调剂 +10 xhr12 2026-04-02 10/500 2026-04-04 21:53 by bn53987
[考研] 化学调剂 +12 艾志恒 2026-04-03 13/650 2026-04-04 20:11 by xhai2011
[考研] 考研调剂 +4 zybz冲冲冲 2026-04-03 6/300 2026-04-04 13:08 by zybz冲冲冲
[考研] 070300化学求调剂 +16 小黄鸭宝 2026-03-30 16/800 2026-04-04 11:49 by asdhh1991
[考研] 297求调剂 +11 ljy20040718! 2026-04-03 13/650 2026-04-04 09:23 by 来看流星雨10
[考研] 求调剂 +4 压力??大 2026-04-03 4/200 2026-04-03 21:36 by 啵啵啵0119
[考研] 329求调剂,一志愿西北工业大学,材料工程(085601) +8 小小机灵虫 2026-03-29 14/700 2026-04-03 19:38 by lijunpoly
[考研] 求调剂 +3 usbdndj 2026-04-03 3/150 2026-04-03 14:10 by dxiaoxin
[考研] 建环,能源,土木老师路过看一看!!! +5 嘿嘿uu 2026-04-01 5/250 2026-04-03 11:47 by znian
[考研] 274求调剂 +10 薛定谔的虎。 2026-04-01 10/500 2026-04-03 10:13 by tianyyysss
[考研] 085600,320分求调剂 +6 大馋小子 2026-04-02 6/300 2026-04-02 21:54 by dongzh2009
[考研] 301求调剂 +4 细胞相关蛋白 2026-04-02 8/400 2026-04-02 16:30 by 271179835
[考研] 0710生物学求调剂 +9 manman511 2026-04-01 9/450 2026-04-02 10:00 by zxl830724
[考研] 377求调剂 +3 RASKIN 2026-04-02 3/150 2026-04-02 09:45 by zzchen2000
[考研] 求0861交通运输专硕or材料专硕调剂 +4 勒布朗@ 2026-03-31 4/200 2026-04-01 09:54 by 一只好果子?
[考研] 求调剂:一志愿:南京大学 专业:0705 总分320 ,本科985,四六级已过 +3 lfy760306 2026-03-31 3/150 2026-04-01 01:57 by Creta
[考研] 一志愿南昌大学324求调剂 +6 hanamiko 2026-03-29 6/300 2026-03-31 16:35 by hypershenger
信息提示
请填处理意见