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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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林祎

木虫 (正式写手)

[求助] 出现这种问题怎么解决

这个蛋白的PDB ID是1N78,在VMD中显示出现两个一模一样的结构,我想在VMD中只展示一个,这个怎么操作?

2013-03-04_182047.png
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jiaoyixiong

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
林祎: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2013-03-04 21:16:08
推荐你去了解一下PDB 文件的格式以及VMD 的atomselect命令
个人感觉学习 VMD 对分子动力学模拟很重要,具体方法:
如果仅仅是显示的话,这样


如果想分离其中的一个,可以使用下面的脚本
mol load pdb 1N78.pdb
set sel [atomselect top "chain A C "]
$sel writepdb ok.pdb[ Last edited by jiaoyixiong on 2013-3-4 at 21:08 ]

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  • 附件 1 : ok.pdb
  • 2013-03-04 21:07:47, 455.23 K
2楼2013-03-04 21:06:15
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林祎

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2013-03-04 21:06:15
推荐你去了解一下PDB 文件的格式以及VMD 的atomselect命令
个人感觉学习 VMD 对分子动力学模拟很重要,具体方法:
如果仅仅是显示的话,这样


如果想分离其中的一个,可以使用下面的脚本
mol load pdb 1N78. ...

谢谢啦
3楼2013-03-04 21:16:52
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