24小时热门版块排行榜    

查看: 268  |  回复: 2

林祎

木虫 (正式写手)

[求助] 出现这种问题怎么解决

这个蛋白的PDB ID是1N78,在VMD中显示出现两个一模一样的结构,我想在VMD中只展示一个,这个怎么操作?

2013-03-04_182047.png
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

VMD 软件

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
林祎: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2013-03-04 21:16:08
推荐你去了解一下PDB 文件的格式以及VMD 的atomselect命令
个人感觉学习 VMD 对分子动力学模拟很重要,具体方法:
如果仅仅是显示的话,这样


如果想分离其中的一个,可以使用下面的脚本
mol load pdb 1N78.pdb
set sel [atomselect top "chain A C "]
$sel writepdb ok.pdb[ Last edited by jiaoyixiong on 2013-3-4 at 21:08 ]

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : ok.pdb
  • 2013-03-04 21:07:47, 455.23 K
2楼2013-03-04 21:06:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

林祎

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2013-03-04 21:06:15
推荐你去了解一下PDB 文件的格式以及VMD 的atomselect命令
个人感觉学习 VMD 对分子动力学模拟很重要,具体方法:
如果仅仅是显示的话,这样


如果想分离其中的一个,可以使用下面的脚本
mol load pdb 1N78. ...

谢谢啦
3楼2013-03-04 21:16:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 林祎 的主题更新
信息提示
请填处理意见