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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » PCR产物再次PCR无条带 只有弥散
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Hopig

铁虫 (初入文坛)

[求助] PCR产物再次PCR无条带 只有弥散

如图所示，左边是两道marker（DL2000和wide range），前四个样是一次PCR的产物，目的大小是3K，总见不着带。然后就把PCR产物稀释1000倍，进行再次PCR，就出现了大片段的弥散，就是图中后四个样。一开始以为稀释倍数不够，还试过10000倍和100000倍，结果类似，弥散稍微弱一些，但是集中的条带还是很大。求高人指点，这到底为啥啊？？？如何改进，才能获得清晰的单带啊？

20130227.jpg
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1楼 2013-03-01 12:31:02
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chenguestc

木虫 (职业作家)
先把DNA跑个胶看下质量和大体浓度，如果是DNA问题则换新DNA，如果DNA没有问题就调整引物浓度和退火温度试试，如果还不行，就换其他引物把，可能是引物确实不特异。每一步都加阴阳对照最好。
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13楼2013-03-05 09:12:16
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chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
试试提高退火温度，降低引物浓度，加入DMSO等方法。前两者或者能解决问题。
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2楼2013-03-01 12:52:56
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潇之天下

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
第一，检测PCR模板；第二，提高退火温度以增加特异性；第三，梯度稀释，同时设阴性和阳性对照。
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修行人
3楼2013-03-01 12:59:18
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Hopig

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by chenguestc at 2013-03-01 12:52:56
试试提高退火温度，降低引物浓度，加入DMSO等方法。前两者或者能解决问题。

这就做上试试~谢！
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4楼2013-03-01 21:06:54
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