24小时热门版块排行榜    

查看: 2724  |  回复: 12
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

2011210200

金虫 (小有名气)


[交流] 想做细菌16rsDNA和真菌18rsDNA的DGGE,16srDNA V3区PCR是怎么回事?

最近开始做不同施肥对土壤细菌、真菌多样性的影响,由于是新手,想请教各位大牛几个问题:看到有些做DGGE是PCR了两次,第一次是16srDNAPCR,第二次是V3区PCR,想问一下为什么要P两次呢?有的文献只写了16srDNA PCR后就去跑DGGE了,V3区PCR是否有必要?18srDNA做DGGE是否需要再做某个区的PCR吗?请大牛们指教,不胜感激!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

DoRbIr

金虫 (正式写手)


★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
2011210200: 金币+8, 谢谢啊!明白了。 2013-02-28 14:20:13
DGGE一般跑的条带是500bp左右的,16S的全长是1.5K左右,所以不可能把整个16S拿去跑DGGE的。有的时候,为增加PCR的成功率,会先扩增16S全长,再特定扩增某个区域,毕竟DGGE的引物往往是要加GC-clamp的。你说的只写了16srDNA也应该是某个区域,而不是全长,你可以再看一下。18S也是同理的。
7楼2013-02-27 16:23:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答

userhung

禁虫 (文学泰斗)


★ ★ ★ ★ ★ ★
2011210200(金币+1): 谢谢参与
scelab: 金币+5, 谢谢 2013-02-26 19:33:53
4楼2013-02-26 18:03:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

2011210200

金虫 (小有名气)


引用回帖:
4楼: Originally posted by userhung at 2013-02-26 18:03:36
http://www.doc88.com/p-15028461028.html
http://www.dxy.cn/bbs/topic/15718080
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2391806

那18srDNA做DGGE需要用某个区的引物扩增吗?
5楼2013-02-26 18:49:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lhwen182

金虫 (正式写手)


引用回帖:
7楼: Originally posted by DoRbIr at 2013-02-27 16:23:46
DGGE一般跑的条带是500bp左右的,16S的全长是1.5K左右,所以不可能把整个16S拿去跑DGGE的。有的时候,为增加PCR的成功率,会先扩增16S全长,再特定扩增某个区域,毕竟DGGE的引物往往是要加GC-clamp的。你说的只写了 ...

就是这样
8楼2013-02-28 12:11:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 268求调剂 +7 一定有学上- 2026-03-14 8/400 2026-03-17 13:10 by zz820
[考研] 药学383 求调剂 +3 药学chy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 20:51 by 元子^0^
[考研] 085601求调剂 +3 Du.11 2026-03-16 3/150 2026-03-16 20:42 by 无际的草原
[考研] 一志愿211 0703方向310分求调剂 +3 努力奋斗112 2026-03-15 3/150 2026-03-16 16:44 by houyaoxu
[考研] 327求调剂 +6 拾光任染 2026-03-15 11/550 2026-03-15 22:47 by 拾光任染
[考博] 东华理工大学化材专业26届硕士博士申请 +6 zlingli 2026-03-13 6/300 2026-03-15 20:00 by ryzcf
[考研] 255求调剂 +3 李嘉慧, 2026-03-12 4/200 2026-03-14 16:58 by 有只狸奴
[考研] 【0703化学调剂】-一志愿华中师范大学-六级475 +5 Becho359 2026-03-11 5/250 2026-03-14 11:35 by 哦哦123
[考研] 材料371求调剂 +9 鳄鱼? 2026-03-11 11/550 2026-03-13 22:53 by JourneyLucky
[考研] 304求调剂 +7 7712b 2026-03-13 7/350 2026-03-13 21:42 by peike
[考研] 333求调剂 +3 球球古力 2026-03-11 3/150 2026-03-13 21:27 by JourneyLucky
[考研] 考研调剂 +4 芬达46 2026-03-12 4/200 2026-03-13 16:04 by ruiyingmiao
[考研] 材料专硕350 求调剂 +4 王金科 2026-03-12 4/200 2026-03-13 16:02 by ruiyingmiao
[考研] 材料301分求调剂 +5 Liyouyumairs 2026-03-12 5/250 2026-03-13 14:42 by JourneyLucky
[考研] 289求调剂 +3 李政莹 2026-03-12 3/150 2026-03-13 11:02 by 求调剂zz
[考研] 0817化学工程与技术考研312分调剂 +3 T123 tt 2026-03-12 3/150 2026-03-13 10:49 by houyaoxu
[考研] 08食品或轻工求调剂,本科发表3篇sci一区top论文,一志愿南师大食品科学与工程 +3 我是一个兵, 2026-03-10 3/150 2026-03-13 10:21 by Yuyi.
[考研] 工科0856专硕化学工程269能调剂吗 +10 我想读研11 2026-03-10 10/500 2026-03-13 10:14 by Yuyi.
[考博] 26申博求助 +3 跳跃饼干 2026-03-10 4/200 2026-03-10 21:15 by Tntcnn
[考研] 求调剂材料专硕293 +6 段_(:з」∠)_ 2026-03-10 6/300 2026-03-10 18:22 by ms629
信息提示
请填处理意见