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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 想做细菌16rsDNA和真菌18rsDNA的DGGE，16srDNA V3区PCR是怎么回事？
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2011210200

金虫 (小有名气)

[交流] 想做细菌16rsDNA和真菌18rsDNA的DGGE，16srDNA V3区PCR是怎么回事？

最近开始做不同施肥对土壤细菌、真菌多样性的影响，由于是新手，想请教各位大牛几个问题：看到有些做DGGE是PCR了两次，第一次是16srDNAPCR，第二次是V3区PCR，想问一下为什么要P两次呢？有的文献只写了16srDNA PCR后就去跑DGGE了，V3区PCR是否有必要？18srDNA做DGGE是否需要再做某个区的PCR吗？请大牛们指教，不胜感激！
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1楼 2013-02-26 17:23:25
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2011210200

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by userhung at 2013-02-26 18:03:36
http://www.doc88.com/p-15028461028.html
http://www.dxy.cn/bbs/topic/15718080
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2391806

那18srDNA做DGGE需要用某个区的引物扩增吗？
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5楼2013-02-26 18:49:45
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2011210200

金虫 (小有名气)
引用回帖:
10楼: Originally posted by 在雨中 at 2013-03-27 09:25:26
真菌推荐你用NS1和Fung引物。
细菌DGGE推荐你用341 518，都可以非常顺利的做出DGGE图谱来。

能否给我一篇相关文献参考下啊，尤其是有详细的引物序列。谢谢您……
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11楼2013-03-27 14:01:44
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