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faile18

金虫 (小有名气)

[求助] 候选基因群体测序

各位虫友,近期在做一个候选基因在96个自交系组成的群体的测序工作,候选基因大小在5kb左右。现在能想到的是以下几种策略:
1、PCR产物测序。可能存在的问题,片段较大,不一定能够完整扩出来,即便能扩出来,产物特异性也不能保证。
2、PCR扩增后。目的产物切胶回收,连接T载体,提质粒检测。
3、分段PCR。产物测序或切胶回收后,连接载体,质粒测序。
暂时能想到的只有这三种策略,各有利弊,烦请诸位做过类似关联分析的虫友给点意见,感激不尽。
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