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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

[求助] 求助设计引物时酶切位点保护碱基的问题

限制性内切酶酶切位点保护碱基不全时如何确定切割率?例如Kpn I 酶切位点是GGTACC        前面加完保护碱基G,后面加完保护碱基C的“GGGTACCC”  它的2h和20h的切割率都是0,别人给我设计的引物只加了前面保护碱基G,后面没有加C,是    GGGGTACC,那切割率是多少呢?会不会根本切不开啊?

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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

引用回帖:
6楼: Originally posted by Haibara_Ai at 2013-02-21 12:43:01
那个表是提醒你那样加不好,随便几个就行,不要有hairpin

加酶切位点时要考虑PMD18T的酶切位点吗?具体是什么原则呢?
13楼2013-02-22 20:46:00
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polepolar

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
如果只加一个保护碱基的话,那切割率是很低的,保险期间还是加3个以上吧.
北京普尔普乐生物技术有限公司(www.polepolar.com)
2楼2013-02-20 17:13:26
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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

引用回帖:
2楼: Originally posted by polepolar at 2013-02-20 17:13:26
如果只加一个保护碱基的话,那切割率是很低的,保险期间还是加3个以上吧.

那请问您能帮我看看我今天下午求助的另外一个表达载体的问题吗?多谢啦
3楼2013-02-20 18:13:11
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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

引用回帖:
2楼: Originally posted by polepolar at 2013-02-20 17:13:26
如果只加一个保护碱基的话,那切割率是很低的,保险期间还是加3个以上吧.

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=5518513
4楼2013-02-20 18:13:47
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