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seven23

新虫 (初入文坛)

[求助] 请问MS动力学的步骤···

利用MS进行了第一步dynamics(NVT,共60ps),产生了一个xtd文件,含有1200个frame。接下来,希望利用第45ps的结构进行第二步dynamics(NPT)应该怎么操作呢?即:需要怎么操作才能得到第45ps的结构并把它作为第二步动力学模拟的起始结构呢?

请各位大神赐教,才接触MS,什么都不懂,让大家见笑了···感谢!
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祝福大家都好运····
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ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

你试着跑一下不就知道了?
5楼2013-02-06 13:12:40
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ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
在最后一个FRAME上跑NPT就可以了
2楼2013-02-06 08:59:23
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seven23

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ddll_slsl at 2013-02-06 08:59:23
在最后一个FRAME上跑NPT就可以了

是用动画功能让XTD文件停在最后一个frame再开始NPT?

是不是停在哪一个FRAME就从哪儿开始进行下一步?感谢您的帮助。
祝福大家都好运····
3楼2013-02-06 11:49:32
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seven23

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ddll_slsl at 2013-02-06 08:59:23
在最后一个FRAME上跑NPT就可以了

45ps难道不是应该为中间的某个frame嘛?我完全糊涂了···
祝福大家都好运····
4楼2013-02-06 11:50:18
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