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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 请问MS动力学的步骤···
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seven23

新虫 (初入文坛)

[求助] 请问MS动力学的步骤···

利用MS进行了第一步dynamics(NVT，共60ps),产生了一个xtd文件，含有1200个frame。接下来，希望利用第45ps的结构进行第二步dynamics(NPT)应该怎么操作呢？即：需要怎么操作才能得到第45ps的结构并把它作为第二步动力学模拟的起始结构呢？

请各位大神赐教，才接触MS，什么都不懂，让大家见笑了···感谢！
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祝福大家都好运····
1楼2013-02-05 02:08:27
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ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

你试着跑一下不就知道了？
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5楼2013-02-06 13:12:40
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ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
在最后一个FRAME上跑NPT就可以了
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2楼2013-02-06 08:59:23
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seven23

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ddll_slsl at 2013-02-06 08:59:23
在最后一个FRAME上跑NPT就可以了

是用动画功能让XTD文件停在最后一个frame再开始NPT?

是不是停在哪一个FRAME就从哪儿开始进行下一步？感谢您的帮助。
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祝福大家都好运····
3楼2013-02-06 11:49:32
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seven23

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ddll_slsl at 2013-02-06 08:59:23
在最后一个FRAME上跑NPT就可以了

45ps难道不是应该为中间的某个frame嘛？我完全糊涂了···
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祝福大家都好运····
4楼2013-02-06 11:50:18
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