应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 关于体系里原子的移动问题
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
101/1返回列表
查看: 1163  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

abel_zhao

银虫 (正式写手)

[求助] 关于体系里原子的移动问题

大家好，我现在正在计算Ni-C表面的模拟计算，在我算到超过2ML的时候（2层以上的C，C一层在表面，其他的在Ni里面）， 会出现原子到处乱跑的情况（不知道术语怎么说，会的高手请指教）， 开始的时候以为是体系不够大（真空10A，6层Ni原子，3层动，3层不动），后来扩大了体系，9层Ni，6层动，3层不动，真空15A，可还是不行，请问谁知道是什么情况，可以给我指点迷津啊，先谢谢了。
下面附上CONCAR的文件，
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-01-30 09:12:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abel_zhao

银虫 (正式写手)
不会上传文件。。。就是原子跑到真空里了，
Ni(001)
   1.00000000000000     
     4.9667181968999996    0.0000000000000000    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    4.9667181968999996    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    0.0000000000000000   32.7800006865999976
   Ni   C
    36     9
Selective dynamics
Direct
  0.0000000000000000  0.0000000000000000  0.0000000000000000   F   F   F
  0.0000000000000000  0.5000000000000000  0.0000000000000000   F   F   F
  0.5000000000000000  0.0000000000000000  0.0000000000000000   F   F   F
  0.5000000000000000  0.5000000000000000  0.0000000000000000   F   F   F
  0.2500000000000000  0.2500000000000000  0.0535665040000026   F   F   F
  0.2500000000000000  0.7500000000000000  0.0535665040000026   F   F   F
  0.7500000000000000  0.2500000000000000  0.0535665040000026   F   F   F
  0.7500000000000000  0.7500000000000000  0.0535665040000026   F   F   F
  0.0000000000000000  0.0000000000000000  0.1071330090000018   F   F   F
  0.0000000000000000  0.5000000000000000  0.1071330090000018   F   F   F
  0.5000000000000000  0.0000000000000000  0.1071330090000018   F   F   F
  0.5000000000000000  0.5000000000000000  0.1071330090000018   F   F   F
  0.2497754641945154  0.2497754641945154  0.1611955403620521   T   T   T
  0.2498157978213711  0.7500981793464383  0.1612771916828672   T   T   T
  0.7500981793464383  0.2498157978213711  0.1612771916828672   T   T   T
  0.7502780111663840  0.7502780111663840  0.1612090191769950   T   T   T
  0.0001546019547758  0.0001546019547758  0.2170422575722820   T   T   T
-0.0001610042685623  0.5002020817075548  0.2220779873766070   T   T   T
  0.5002020817075548 -0.0001610042685623  0.2220779873766070   T   T   T
  0.4998840500268282  0.4998840500268282  0.2162837223858605   T   T   T
  0.2499099019954192  0.2499099019954192  0.2903373952379834   T   T   T
  0.2498327056064960  0.7500968045787229  0.2883474581677031   T   T   T
  0.7500968045787229  0.2498327056064960  0.2883474581677031   T   T   T
  0.7500858171187234  0.7500858171187234  0.2898934819514454   T   T   T
-0.0128172779337969 -0.0128172779337969  0.3521749036310198   T   T   T
-0.0133792098495905  0.5134919464798787  0.3522810573000540   T   T   T
  0.5134919464798787 -0.0133792098495905  0.3522810573000540   T   T   T
  0.5130615313195126  0.5130615313195126  0.3521627557698155   T   T   T
  0.2500180766511435  0.2500180766511435  0.4497548529793234   T   T   T
  0.2500335925681680  0.7499602045690146  0.4108524775802431   T   T   T
  0.7499602045690146  0.2500335925681680  0.4108524775802431   T   T   T
  0.7499004679307149  0.7499004679307149  0.4116747929356454   T   T   T
-0.0069061510032320 -0.0069061510032320  0.5016829416902375   T   T   T
-0.0069306013633213  0.5068918410849463  0.5016938067492502   T   T   T
  0.5068918410849463 -0.0069306013633213  0.5016938067492502   T   T   T
  0.5069018816776780  0.5069018816776780  0.5016822106912066   T   T   T
  0.2499994740913793  0.2499994740913793  0.5167222643253839   T   T   T
  0.2499915382448343  0.7499924755656414  0.5155237004518244   T   T   T
  0.7499924755656414  0.2499915382448343  0.5155237004518244   T   T   T
  0.7499663840193218  0.7499663840193218  0.5162845367872310   T   T   T
  0.5067885556891168  0.5067885556891168  0.4362440085993919   T   T   T
-0.0068239159515835 -0.0068239159515835  0.4362067657985764   T   T   T
-0.0065787602597067  0.5066240625013768  0.4362540388758980   T   T   T
  0.5066240625013768 -0.0065787602597067  0.4362540388758980   T   T   T
  0.2499824530787539  0.2499824530787539  0.3505929283338219   T   T   T
赞一下 回复此楼
2楼2013-01-30 09:16:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abel_zhao

银虫 (正式写手)
谁来救我？
回复此楼
3楼2013-01-30 09:44:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abel_zhao

银虫 (正式写手)
INCAR文件也发出来吧
PREC=accurate
ISPIN=2
ENCUT=500
NELMIN=4
EDIFF=1E-5
NSW=150
IBRION=2
POTIM=0.5
ALGO=Fast
ISMEAR=1
SIGMA=0.1
ADDGRID=T
LWAVE=F
LCHARG=F
LREAL=F
LASPH=T
LORBIT=10
IDIPOL=3
LDIPOL=T
赞一下 回复此楼
4楼2013-01-30 10:12:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abel_zhao

银虫 (正式写手)
没人知道吗？
回复此楼
5楼2013-01-30 11:50:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Lathander

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
abel_zhao: 金币+1, ★有帮助, 谢谢参与！ 2013-01-30 13:12:07
引用回帖:
2楼: Originally posted by abel_zhao at 2013-01-30 09:16:03
不会上传文件。。。就是原子跑到真空里了，
Ni(001)
   1.00000000000000     
     4.9667181968999996    0.0000000000000000    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    4.9667181968999996    0.00 ...

没明白，哪个原子跑真空了？这不四个C在surface，四个在subsurface，一个在third layer吗？
赞一下 回复此楼
6楼2013-01-30 11:59:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abel_zhao

银虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by Lathander at 2013-01-30 11:59:58
没明白，哪个原子跑真空了？这不四个C在surface，四个在subsurface，一个在third layer吗？...

首先，谢谢你的回复，这个是原子不规则运动，出来的是不可能的结构。

下面发的是到真空的，6个C在表面的
Ni(001)
   1.00000000000000     
     4.9667181968999996    0.0000000000000000    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    4.9667181968999996    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    0.0000000000000000   32.7800006865999976
   Ni   C
    36     9
Selective dynamics
Direct
  0.0000000000000000  0.0000000000000000  0.0000000000000000   F   F   F
  0.0000000000000000  0.5000000000000000  0.0000000000000000   F   F   F
  0.5000000000000000  0.0000000000000000  0.0000000000000000   F   F   F
  0.5000000000000000  0.5000000000000000  0.0000000000000000   F   F   F
  0.2500000000000000  0.2500000000000000  0.0535665040000026   F   F   F
  0.2500000000000000  0.7500000000000000  0.0535665040000026   F   F   F
  0.7500000000000000  0.2500000000000000  0.0535665040000026   F   F   F
  0.7500000000000000  0.7500000000000000  0.0535665040000026   F   F   F
  0.0000000000000000  0.0000000000000000  0.1071330090000018   F   F   F
  0.0000000000000000  0.5000000000000000  0.1071330090000018   F   F   F
  0.5000000000000000  0.0000000000000000  0.1071330090000018   F   F   F
  0.5000000000000000  0.5000000000000000  0.1071330090000018   F   F   F
  0.2497754641945154  0.2497754641945154  0.1611955403620521   T   T   T
  0.2498157978213711  0.7500981793464383  0.1612771916828672   T   T   T
  0.7500981793464383  0.2498157978213711  0.1612771916828672   T   T   T
  0.7502780111663840  0.7502780111663840  0.1612090191769950   T   T   T
  0.0001546019547758  0.0001546019547758  0.2170422575722820   T   T   T
-0.0001610042685623  0.5002020817075548  0.2220779873766070   T   T   T
  0.5002020817075548 -0.0001610042685623  0.2220779873766070   T   T   T
  0.4998840500268282  0.4998840500268282  0.2162837223858605   T   T   T
  0.2499099019954192  0.2499099019954192  0.2903373952379834   T   T   T
  0.2498327056064960  0.7500968045787229  0.2883474581677031   T   T   T
  0.7500968045787229  0.2498327056064960  0.2883474581677031   T   T   T
  0.7500858171187234  0.7500858171187234  0.2898934819514454   T   T   T
-0.0128172779337969 -0.0128172779337969  0.3521749036310198   T   T   T
-0.0133792098495905  0.5134919464798787  0.3522810573000540   T   T   T
  0.5134919464798787 -0.0133792098495905  0.3522810573000540   T   T   T
  0.5130615313195126  0.5130615313195126  0.3521627557698155   T   T   T
  0.2500180766511435  0.2500180766511435  0.4497548529793234   T   T   T
  0.2500335925681680  0.7499602045690146  0.4108524775802431   T   T   T
  0.7499602045690146  0.2500335925681680  0.4108524775802431   T   T   T
  0.7499004679307149  0.7499004679307149  0.4116747929356454   T   T   T
-0.0069061510032320 -0.0069061510032320  0.5016829416902375   T   T   T
-0.0069306013633213  0.5068918410849463  0.5016938067492502   T   T   T
  0.5068918410849463 -0.0069306013633213  0.5016938067492502   T   T   T
  0.5069018816776780  0.5069018816776780  0.5016822106912066   T   T   T
  0.2499994740913793  0.2499994740913793  0.5167222643253839   T   T   T
  0.2499915382448343  0.7499924755656414  0.5155237004518244   T   T   T
  0.7499924755656414  0.2499915382448343  0.5155237004518244   T   T   T
  0.7499663840193218  0.7499663840193218  0.5162845367872310   T   T   T
  0.5067885556891168  0.5067885556891168  0.4362440085993919   T   T   T
-0.0068239159515835 -0.0068239159515835  0.4362067657985764   T   T   T
-0.0065787602597067  0.5066240625013768  0.4362540388758980   T   T   T
  0.5066240625013768 -0.0065787602597067  0.4362540388758980   T   T   T
  0.2499824530787539  0.2499824530787539  0.3505929283338219   T   T   T
赞一下 回复此楼
7楼2013-01-30 13:11:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abel_zhao

银虫 (正式写手)
HELP~~
回复此楼
8楼2013-01-31 11:47:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abel_zhao

银虫 (正式写手)
已经线下解决。
回复此楼
9楼2013-02-05 10:32:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

umklapp

银虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by abel_zhao at 2013-02-04 14:32:34
已经线下解决。

你是如何解决的？
赞一下 回复此楼
10楼2013-02-13 05:43:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 abel_zhao 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂 +3 图鉴212 2026-03-30 3/150 2026-03-31 00:31 by jp9609
[考研] 085600材料与化工调剂 +14 kikiki7 2026-03-30 14/700 2026-03-31 00:20 by jp9609
[考研] 274求调剂 +4 xiao爱同学 2026-03-30 4/200 2026-03-31 00:04 by jp9609
[考研] 哈尔滨工业大学材料与化工专硕378求调剂 +3 塔比乌斯 2026-03-30 3/150 2026-03-30 22:55 by 无际的草原
[考研] 抱歉 +4 田洪有 2026-03-30 4/200 2026-03-30 21:26 by mumin1990
[考研] 083000学硕274求调剂 +9 Li李鱼 2026-03-26 9/450 2026-03-30 21:06 by dophin1985
[考研] 297 地理学070500 复试求调剂 +3 小圆圈圈ooo 2026-03-30 3/150 2026-03-30 21:05 by 余震yz
[考研] 085601材料工程找调剂 +17 oatmealR 2026-03-29 18/900 2026-03-30 19:21 by Wang200018
[考研] 291求调剂 +8 HanBeiNingZC 2026-03-24 8/400 2026-03-30 17:01 by 无际的草原
[考研] 070300一志愿211，312分求调剂院校 +4 小黄鸭宝 2026-03-30 4/200 2026-03-30 11:49 by 棒棒球手
[考研] 一志愿中南大学化学0703总分337求调剂 +6 niko- 2026-03-27 6/300 2026-03-30 10:25 by herarysara
[考研] 求调剂 +4 QiMing7 2026-03-25 5/250 2026-03-29 21:10 by 唐沐儿
[考研] 一志愿南昌大学324求调剂 +5 hanamiko 2026-03-29 5/250 2026-03-29 16:46 by 学员8dgXkO
[考研] 312，生物学求调剂 +3 小译同学abc 2026-03-28 3/150 2026-03-28 15:32 by 落睿可思
[考研] 394求调剂 +3 好事多磨静候佳� 2026-03-26 5/250 2026-03-28 14:24 by 唐沐儿
[考研] 081200-314 +3 LILIQQ 2026-03-27 4/200 2026-03-28 09:41 by 保护地球你我做�
[考研] 315调剂 +4 0860求调剂 2026-03-26 5/250 2026-03-27 11:23 by wangjy2002
[考研] 314求调剂 +3 溪云珂 2026-03-26 3/150 2026-03-27 11:20 by sanrepian
[考研] 一志愿吉大071010，316分求调剂 +3 xgbiknn 2026-03-27 3/150 2026-03-27 10:36 by guoweigw
[考研] 网络空间安全0839招调剂 +4 w320357296 2026-03-25 6/300 2026-03-25 17:59 by 255671
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭