应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 关于体系里原子的移动问题
101/1返回列表
查看: 1022  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

abel_zhao

银虫 (正式写手)

[求助] 关于体系里原子的移动问题

大家好，我现在正在计算Ni-C表面的模拟计算，在我算到超过2ML的时候（2层以上的C，C一层在表面，其他的在Ni里面）， 会出现原子到处乱跑的情况（不知道术语怎么说，会的高手请指教）， 开始的时候以为是体系不够大（真空10A，6层Ni原子，3层动，3层不动），后来扩大了体系，9层Ni，6层动，3层不动，真空15A，可还是不行，请问谁知道是什么情况，可以给我指点迷津啊，先谢谢了。
下面附上CONCAR的文件，
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-01-30 09:12:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abel_zhao

银虫 (正式写手)
不会上传文件。。。就是原子跑到真空里了，
Ni(001)
   1.00000000000000     
     4.9667181968999996    0.0000000000000000    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    4.9667181968999996    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    0.0000000000000000   32.7800006865999976
   Ni   C
    36     9
Selective dynamics
Direct
  0.0000000000000000  0.0000000000000000  0.0000000000000000   F   F   F
  0.0000000000000000  0.5000000000000000  0.0000000000000000   F   F   F
  0.5000000000000000  0.0000000000000000  0.0000000000000000   F   F   F
  0.5000000000000000  0.5000000000000000  0.0000000000000000   F   F   F
  0.2500000000000000  0.2500000000000000  0.0535665040000026   F   F   F
  0.2500000000000000  0.7500000000000000  0.0535665040000026   F   F   F
  0.7500000000000000  0.2500000000000000  0.0535665040000026   F   F   F
  0.7500000000000000  0.7500000000000000  0.0535665040000026   F   F   F
  0.0000000000000000  0.0000000000000000  0.1071330090000018   F   F   F
  0.0000000000000000  0.5000000000000000  0.1071330090000018   F   F   F
  0.5000000000000000  0.0000000000000000  0.1071330090000018   F   F   F
  0.5000000000000000  0.5000000000000000  0.1071330090000018   F   F   F
  0.2497754641945154  0.2497754641945154  0.1611955403620521   T   T   T
  0.2498157978213711  0.7500981793464383  0.1612771916828672   T   T   T
  0.7500981793464383  0.2498157978213711  0.1612771916828672   T   T   T
  0.7502780111663840  0.7502780111663840  0.1612090191769950   T   T   T
  0.0001546019547758  0.0001546019547758  0.2170422575722820   T   T   T
-0.0001610042685623  0.5002020817075548  0.2220779873766070   T   T   T
  0.5002020817075548 -0.0001610042685623  0.2220779873766070   T   T   T
  0.4998840500268282  0.4998840500268282  0.2162837223858605   T   T   T
  0.2499099019954192  0.2499099019954192  0.2903373952379834   T   T   T
  0.2498327056064960  0.7500968045787229  0.2883474581677031   T   T   T
  0.7500968045787229  0.2498327056064960  0.2883474581677031   T   T   T
  0.7500858171187234  0.7500858171187234  0.2898934819514454   T   T   T
-0.0128172779337969 -0.0128172779337969  0.3521749036310198   T   T   T
-0.0133792098495905  0.5134919464798787  0.3522810573000540   T   T   T
  0.5134919464798787 -0.0133792098495905  0.3522810573000540   T   T   T
  0.5130615313195126  0.5130615313195126  0.3521627557698155   T   T   T
  0.2500180766511435  0.2500180766511435  0.4497548529793234   T   T   T
  0.2500335925681680  0.7499602045690146  0.4108524775802431   T   T   T
  0.7499602045690146  0.2500335925681680  0.4108524775802431   T   T   T
  0.7499004679307149  0.7499004679307149  0.4116747929356454   T   T   T
-0.0069061510032320 -0.0069061510032320  0.5016829416902375   T   T   T
-0.0069306013633213  0.5068918410849463  0.5016938067492502   T   T   T
  0.5068918410849463 -0.0069306013633213  0.5016938067492502   T   T   T
  0.5069018816776780  0.5069018816776780  0.5016822106912066   T   T   T
  0.2499994740913793  0.2499994740913793  0.5167222643253839   T   T   T
  0.2499915382448343  0.7499924755656414  0.5155237004518244   T   T   T
  0.7499924755656414  0.2499915382448343  0.5155237004518244   T   T   T
  0.7499663840193218  0.7499663840193218  0.5162845367872310   T   T   T
  0.5067885556891168  0.5067885556891168  0.4362440085993919   T   T   T
-0.0068239159515835 -0.0068239159515835  0.4362067657985764   T   T   T
-0.0065787602597067  0.5066240625013768  0.4362540388758980   T   T   T
  0.5066240625013768 -0.0065787602597067  0.4362540388758980   T   T   T
  0.2499824530787539  0.2499824530787539  0.3505929283338219   T   T   T
赞一下 回复此楼
2楼2013-01-30 09:16:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abel_zhao

银虫 (正式写手)
谁来救我？
回复此楼
3楼2013-01-30 09:44:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abel_zhao

银虫 (正式写手)
INCAR文件也发出来吧
PREC=accurate
ISPIN=2
ENCUT=500
NELMIN=4
EDIFF=1E-5
NSW=150
IBRION=2
POTIM=0.5
ALGO=Fast
ISMEAR=1
SIGMA=0.1
ADDGRID=T
LWAVE=F
LCHARG=F
LREAL=F
LASPH=T
LORBIT=10
IDIPOL=3
LDIPOL=T
赞一下 回复此楼
4楼2013-01-30 10:12:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abel_zhao

银虫 (正式写手)
没人知道吗？
回复此楼
5楼2013-01-30 11:50:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Lathander

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
abel_zhao: 金币+1, ★有帮助, 谢谢参与！ 2013-01-30 13:12:07
引用回帖:
2楼: Originally posted by abel_zhao at 2013-01-30 09:16:03
不会上传文件。。。就是原子跑到真空里了，
Ni(001)
   1.00000000000000     
     4.9667181968999996    0.0000000000000000    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    4.9667181968999996    0.00 ...

没明白，哪个原子跑真空了？这不四个C在surface，四个在subsurface，一个在third layer吗？
赞一下 回复此楼
6楼2013-01-30 11:59:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abel_zhao

银虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by Lathander at 2013-01-30 11:59:58
没明白，哪个原子跑真空了？这不四个C在surface，四个在subsurface，一个在third layer吗？...

首先，谢谢你的回复，这个是原子不规则运动，出来的是不可能的结构。

下面发的是到真空的，6个C在表面的
Ni(001)
   1.00000000000000     
     4.9667181968999996    0.0000000000000000    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    4.9667181968999996    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    0.0000000000000000   32.7800006865999976
   Ni   C
    36     9
Selective dynamics
Direct
  0.0000000000000000  0.0000000000000000  0.0000000000000000   F   F   F
  0.0000000000000000  0.5000000000000000  0.0000000000000000   F   F   F
  0.5000000000000000  0.0000000000000000  0.0000000000000000   F   F   F
  0.5000000000000000  0.5000000000000000  0.0000000000000000   F   F   F
  0.2500000000000000  0.2500000000000000  0.0535665040000026   F   F   F
  0.2500000000000000  0.7500000000000000  0.0535665040000026   F   F   F
  0.7500000000000000  0.2500000000000000  0.0535665040000026   F   F   F
  0.7500000000000000  0.7500000000000000  0.0535665040000026   F   F   F
  0.0000000000000000  0.0000000000000000  0.1071330090000018   F   F   F
  0.0000000000000000  0.5000000000000000  0.1071330090000018   F   F   F
  0.5000000000000000  0.0000000000000000  0.1071330090000018   F   F   F
  0.5000000000000000  0.5000000000000000  0.1071330090000018   F   F   F
  0.2497754641945154  0.2497754641945154  0.1611955403620521   T   T   T
  0.2498157978213711  0.7500981793464383  0.1612771916828672   T   T   T
  0.7500981793464383  0.2498157978213711  0.1612771916828672   T   T   T
  0.7502780111663840  0.7502780111663840  0.1612090191769950   T   T   T
  0.0001546019547758  0.0001546019547758  0.2170422575722820   T   T   T
-0.0001610042685623  0.5002020817075548  0.2220779873766070   T   T   T
  0.5002020817075548 -0.0001610042685623  0.2220779873766070   T   T   T
  0.4998840500268282  0.4998840500268282  0.2162837223858605   T   T   T
  0.2499099019954192  0.2499099019954192  0.2903373952379834   T   T   T
  0.2498327056064960  0.7500968045787229  0.2883474581677031   T   T   T
  0.7500968045787229  0.2498327056064960  0.2883474581677031   T   T   T
  0.7500858171187234  0.7500858171187234  0.2898934819514454   T   T   T
-0.0128172779337969 -0.0128172779337969  0.3521749036310198   T   T   T
-0.0133792098495905  0.5134919464798787  0.3522810573000540   T   T   T
  0.5134919464798787 -0.0133792098495905  0.3522810573000540   T   T   T
  0.5130615313195126  0.5130615313195126  0.3521627557698155   T   T   T
  0.2500180766511435  0.2500180766511435  0.4497548529793234   T   T   T
  0.2500335925681680  0.7499602045690146  0.4108524775802431   T   T   T
  0.7499602045690146  0.2500335925681680  0.4108524775802431   T   T   T
  0.7499004679307149  0.7499004679307149  0.4116747929356454   T   T   T
-0.0069061510032320 -0.0069061510032320  0.5016829416902375   T   T   T
-0.0069306013633213  0.5068918410849463  0.5016938067492502   T   T   T
  0.5068918410849463 -0.0069306013633213  0.5016938067492502   T   T   T
  0.5069018816776780  0.5069018816776780  0.5016822106912066   T   T   T
  0.2499994740913793  0.2499994740913793  0.5167222643253839   T   T   T
  0.2499915382448343  0.7499924755656414  0.5155237004518244   T   T   T
  0.7499924755656414  0.2499915382448343  0.5155237004518244   T   T   T
  0.7499663840193218  0.7499663840193218  0.5162845367872310   T   T   T
  0.5067885556891168  0.5067885556891168  0.4362440085993919   T   T   T
-0.0068239159515835 -0.0068239159515835  0.4362067657985764   T   T   T
-0.0065787602597067  0.5066240625013768  0.4362540388758980   T   T   T
  0.5066240625013768 -0.0065787602597067  0.4362540388758980   T   T   T
  0.2499824530787539  0.2499824530787539  0.3505929283338219   T   T   T
赞一下 回复此楼
7楼2013-01-30 13:11:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abel_zhao

银虫 (正式写手)
HELP~~
回复此楼
8楼2013-01-31 11:47:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abel_zhao

银虫 (正式写手)
已经线下解决。
回复此楼
9楼2013-02-05 10:32:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

umklapp

银虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by abel_zhao at 2013-02-04 14:32:34
已经线下解决。

你是如何解决的？
赞一下 回复此楼
10楼2013-02-13 05:43:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 abel_zhao 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭