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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » materials studio分子模拟模板剂在沸石中的位置
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tlbbcq

新虫 (小有名气)

[求助] materials studio分子模拟模板剂在沸石中的位置

大家好：
我是分子模拟的新人，很多东西都不懂。现在在模拟四丙基氢氧化铵TPAOH在ZSM-5笼子中的动力学平衡位置。我知道经过动力学计算之后，TPA分子会到达平衡位置，但是我不明白，到底在模拟之前，我应该把分子加到沸石的那个位置呢？仅仅是笼子里就行呢？还是需要放在笼子的质心呢？ 分子动力学MD模拟对分子的位置并未有很大改变，因此初始的放置位置很取决于操作者的习惯，那么这个初始位置到底应该在哪里呢？请大家不吝指教。
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1楼 2013-01-30 01:40:25
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ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2013-02-19 20:04:12
如果你大致知道其平衡位置， 可以放于附近的地方，这样便于计算。
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2楼2013-02-07 09:53:37
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tlbbcq

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ddll_slsl at 2013-02-07 09:53:37
如果你大致知道其平衡位置， 可以放于附近的地方，这样便于计算。

我也这样认为，不过好像用能量最小化也只是稍稍移动，万一我放错位置，可能算出来能量差很多
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3楼2013-03-11 13:12:09
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