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汕头大学海洋科学、生物学、生物与医药接受调剂
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tlbbcq

新虫 (小有名气)

[求助] materials studio分子模拟模板剂在沸石中的位置

大家好:
我是分子模拟的新人,很多东西都不懂。现在在模拟四丙基氢氧化铵TPAOH在ZSM-5笼子中的动力学平衡位置。我知道经过动力学计算之后,TPA分子会到达平衡位置,但是我不明白,到底在模拟之前,我应该把分子加到沸石的那个位置呢?仅仅是笼子里就行呢?还是需要放在笼子的质心呢? 分子动力学MD模拟对分子的位置并未有很大改变,因此初始的放置位置很取决于操作者的习惯,那么这个初始位置到底应该在哪里呢?请大家不吝指教。
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ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2013-02-19 20:04:12
如果你大致知道其平衡位置, 可以放于附近的地方,这样便于计算。
2楼2013-02-07 09:53:37
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tlbbcq

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ddll_slsl at 2013-02-07 09:53:37
如果你大致知道其平衡位置, 可以放于附近的地方,这样便于计算。

我也这样认为,不过好像用能量最小化也只是稍稍移动,万一我放错位置,可能算出来能量差很多
3楼2013-03-11 13:12:09
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