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hopeseababy

木虫 (小有名气)

[求助] 请问做CCA分析的过程中,如何计算VIF

请问在做CCA分析的过程中,如何计算VIF?



我的环境变量有20个,物种有58种,样方有42个

我想要剔除一些环境变量,但是不知道VIF怎么计算。


谢谢。
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hopeseababy

木虫 (小有名气)

我自己摸索出来了,在log文件里有显示的,如下:

大于20的,一般就被预选掉了.

N        name           (weighted) mean           stand. dev.        inflation factor

    1        SPEC AX1                0.0000                0.9176
    2        SPEC AX2                0.0000                0.9151
    3        SPEC AX3                0.0000                0.8807
    4        SPEC AX4                0.0000                0.8514
    5        ENVI AX1                0.0000                0.9167
    6        ENVI AX2                0.0000                0.8977
    7        ENVI AX3                0.0000                0.8709
    8        ENVI AX4                0.0000                0.8476
    2        Vm                      1.4719                0.0876               28.7939
    3        Sh                      0.3376                0.0852              158.6799
    4        Cp                      0.5658                0.0978               49.0258
    5        Bd                      0.0214                0.0057               64.8866
    6        Mm                      1.4616                0.2097              295.6686
    7        Ph                      0.8575                0.0297              155.0193
    8        Cd                      0.4597                0.1407               31.7833
    9        Cy                      1.4118                0.1686               28.6348
   10        St                      1.2609                0.1571               42.3531
   11        Om                      1.0522                0.3420               18.4103
   12        Tn                      0.0602                0.0338               77.0852
   13        Kk                      0.0536                0.0242               27.0853
   14        Mg                      0.1156                0.0385               81.5601
   15        Ca                      0.5900                0.1025              179.8860
   16        Na                      0.0116                0.0043               22.7098
   17        TP                      2.5614                0.2396               23.7467
   18        H                       1.0732                0.2043               54.2759
   19        L                       1.9986                0.2929               17.8595
   20        Y                       0.7195                0.1352               87.8559
   21        S                       1.7652                0.0480               12.9100
   22        A                      -0.1567                0.5465               89.7867
   23        Arbor                   0.0161                0.0277              517.5525
   24        Shrub                   0.0169                0.0289               31.7450
   25        Wedtl                   0.0346                0.0707              274.7634
2楼2013-02-02 13:19:14
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