24小时热门版块排行榜

返回列表

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

summer2771

木虫 (正式写手)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 12136.9
散金: 118
红花: 4
帖子: 875
在线: 233.7小时
虫号: 680481
注册: 2008-12-23
专业: 细胞信号转导

[交流] 蛋白质总量，变还是不变！？已有8人参与

请教大家的意见，经常可以看到论文中（包括学位论文），只做某些蛋白的磷酸化表达，而不做蛋白总量表达。是否可以理解为，某蛋白的总量跟内参一样，是相对恒定不变的，即便是有波动，但也并无显著性差异。由此则只要计算出磷酸化表达的相对量即可说明磷酸化率究竟是上升还是下调，从而表明该蛋白的变化。
我的实验中出现了有好多例都是各个组的蛋白总量也是有显著不同的，磷酸化表达也是不同的，我用磷酸化表达/总量表达的Ratio来说明问题，出现的趋势却可能是跟磷酸化、总量本身的变化趋势相反，即磷酸化、总量均上升，但是Ratio却可能是下调的。
看国外国内很多的论文，从条带上来看，基本上总量似乎是没有差异的。
我就有点纳闷了，难道我的实验出现了问题？

回复此楼

» 猜你喜欢

1楼 2013-01-24 23:12:34

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

ccharlien

木虫 (正式写手)

MolEPI: 1
应助: 82 (初中生)
金币: 2630.1
红花: 3
帖子: 334
在线: 180.3小时
虫号: 1168776
注册: 2010-12-13
性别: GG

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

引用回帖:

20楼: Originally posted by summer2771 at 2013-01-30 17:45:08
呵呵，我是这个意思，某个蛋白不是会有蛋白总量的抗体和磷酸化位点的抗体嘛。我是问有没有可能会蛋白总量的表达下降而用磷酸化位点做出来的表达却是上升趋势（磷酸化位点的表达/总量才是磷酸化或者说是磷酸化率呗， ...

1.Western做的倍数只是看看的，表示这一次实验在这种特定情况下的倍数，并不表示实际量的倍数。换个同样位点的磷酸化抗体，换个稀释度，换个曝光时间，数据的偏差会很大，所以说western把图放上去就行了，有没差别差别有多大一目了然，做灰度什么的也就撑撑篇幅。而且我觉得在一张膜上做一次是必要的。
2.选用的内参的量在处理下改变不改变也是需要确定的因素，为了数据的严谨做一组内参的筛选可以确保可靠。
不过如果实验都做完了的话也无所谓了，把数据卖个好价钱就行