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summer2771

木虫 (正式写手)

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[交流] 蛋白质总量，变还是不变！？已有8人参与

请教大家的意见，经常可以看到论文中（包括学位论文），只做某些蛋白的磷酸化表达，而不做蛋白总量表达。是否可以理解为，某蛋白的总量跟内参一样，是相对恒定不变的，即便是有波动，但也并无显著性差异。由此则只要计算出磷酸化表达的相对量即可说明磷酸化率究竟是上升还是下调，从而表明该蛋白的变化。
我的实验中出现了有好多例都是各个组的蛋白总量也是有显著不同的，磷酸化表达也是不同的，我用磷酸化表达/总量表达的Ratio来说明问题，出现的趋势却可能是跟磷酸化、总量本身的变化趋势相反，即磷酸化、总量均上升，但是Ratio却可能是下调的。
看国外国内很多的论文，从条带上来看，基本上总量似乎是没有差异的。
我就有点纳闷了，难道我的实验出现了问题？

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1楼 2013-01-24 23:12:34

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summer2771

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引用回帖:

14楼: Originally posted by ccharlien at 2013-01-26 17:16:01
Western本身只能半定量，没有那么准的，误差不小，用来取灰度值的照片要曝光的尽量浅才能看出差异
这些数值差异都太小，磷/总应该是 1 1.29 1.16吧
要我看就是处理组总量不变磷酸化上升，我会再进行一次实验验证...

我的意思就是想问问，是不是会出现总蛋白量略减少，比如上面例子中的0.95、0.93，但是磷酸化表达却增加，为1.1或1.2的情况呢？