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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体软件 » 请教Platon计算cif孔隙率的问题！！！！！！！！！急啊
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gongwei924

金虫 (正式写手)

九五之尊
引用回帖:
10楼: Originally posted by ifent at 2013-01-26 22:31:55
哦，也就是说晶体精修完后，没有任何溶剂分子？？

你所说的溶剂分子是不是那些与主体结构不相连的那些单元啊？如果是的话就没有。。。
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11楼2013-01-27 03:06:20
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ifent

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
gongwei924: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2013-06-30 23:24:59
嗯，我说的就是游离溶剂分子，如果没有的话.....
引用一句MOF文章常引用的话：自然厌恶真空。呵呵，翻得不太好啊，就是说如果没有溶剂分子，那就不会存在较大的孔道，因为你的晶体是在溶剂里长出来的，怎么可能有真空部分存在呢？
如果晶体孔道较小（<0.5nm，不除去范德华半径）,没有溶剂分子也是合理的，但是如此小的孔道的孔道率也是很小的，所以说算不出来也许是正常的。一般platonic 对于太小的孔道率是算不出来的。
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12楼2013-01-27 12:17:21
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gongwei924

金虫 (正式写手)

九五之尊
引用回帖:
12楼: Originally posted by ifent at 2013-01-27 12:17:21
嗯，我说的就是游离溶剂分子，如果没有的话.....
引用一句MOF文章常引用的话：自然厌恶真空。呵呵，翻得不太好啊，就是说如果没有溶剂分子，那就不会存在较大的孔道，因为你的晶体是在溶剂里长出来的，怎么可能有真 ...

原来是这样。。。但是根据热重分析来看是有溶剂水分子存在于孔道中的。。看来我要找个人手把手教下怎么删除溶剂分子。
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13楼2013-01-27 15:17:26
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Wendy.W

新虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by ifent at 2013-01-26 20:39:33
好吧，先在修晶体的软件如shelex中删去溶剂分子，然后refine，用新生成的res或cif进行计算，在PWT中，publish>calc all,然后在运行结果中可以找到孔道

hi，我不知道从得到的文件里哪里看孔隙率和孔径大小，不知道那几个数据是。您看到了告知一下好吗？
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花有重开日，人无再少年
14楼2014-12-26 19:58:43
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Super灬神话

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ifent at 2013-01-24 22:56:49
你的孔道是不是很小，而且孔道也不多吧，那platon有可能给出这样的结果。你可以在PWT中，publish>calc all,然后在运行结果中可以找到孔道率。

麻烦问一下 具体哪个数据是表示孔隙率的  我也是新手没找到 。。。
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15楼2017-02-19 21:31:24
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