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wanlichuan木虫 (著名写手)
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只知道单胞参数和组成晶体的分子的结构,不知道单晶结构时,如何用MS构建晶体模型?
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如题,我只知道一种晶体的单胞参数和组成该晶体的分子的结构,但不知道单晶结构,该如何用Materials Studio构建晶体模型呢?MS说明书“Building a starting model”部分说,分为以下四个步骤: 1、Build an empty unit cell using information obtained from indexing the experimental powder pattern and by determining the space group. (根据单胞参数构建一个空单胞)。 2、In one or more separate 3D model documents, construct models for the molecules and/or atoms that form the asymmetric unit of the crystal.(在另一个3D模型文件中画出分子结构)。 3、Define the structural degrees of freedom for each of the fragments in the asymmetric unit. (确定非对称单元的结构自由度)。 4、Build an initial crystal structure by copying the molecules and/or atoms that form the asymmetric unit from their 3D model documents into the empty lattice constructed in steps 1 and 2 above. Use the “Edit/Copy”and “Edit /Paste” commands to do this. (把2步骤里画好的分子结构拷进1步骤里建好的空单胞中)。 There are no limits on the unit cell size or on the number of atoms in the unit cell. 我遇到的问题主要在第4步,在用复制-粘贴命令的时候,发现粘贴过去会出现好几个非对称单元的结构(常常是4个),造成单胞中非常拥挤,就算用鼠标拖开,后面用forcite优化的时候,还是会到一起去,并且没办法删掉其中一个,因为这四个其实是通过对称性联系起来的,删一个就全部消失。我的问题是,这一步有没有办法控制非对称单元的个数(即通常说的Z值)?难道最少是4个吗?当然我想少一些(想多很容易,多复制-粘贴几次就可以了),比如想控制Z=1或Z=2,怎么办? 期待高手解答。非常感谢。 ![]() ![]() |
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