24小时热门版块排行榜    

查看: 3323  |  回复: 16
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

wangzhe163

金虫 (小有名气)

[求助] 荧光定量PCR扩增效率低

哪位高人在做相对荧光定量PCR?我最近在做标准曲线的时候遇到麻烦了,还请高人指点迷津啊。
    在绘制标准曲线的时候,标准品是重组质粒,按10倍倍比稀释,取六个稀释度做标准线,R方能在0.99以上,但是扩增效率一直徘徊在55%-75%之间。,看网上说的解决办法:增加引物浓度,降低退火温度,改用三步法,(质粒线性化,我连的T-simple,这个载体上面应该有一个ECORV的酶切位点,但是我就是切不开)。这些方法我都试过了,引物也重新设计了sweat:,用的试剂是宝生物的SYBR,仪器是ABI 7500.
    小弟已困惑多日,请高人指点,在此谢过!
回复此楼
拼搏定能成功
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangzhe163

金虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by yinchang at 2013-01-22 10:37:55
建议你用hindIII切一下线性化质粒,部分材料上说质粒的形态会影响扩增的效率。另外,今年AEM今年有篇文章专门讨论定量扩增效率的,建议你看一下,我阅读的结论是只要有合适的分析方法,没有必要过分纠结于扩增效率, ...

要求是内参的扩增效率和待测的扩增效率是一直的,要么都低,要么都高,现在是待测因子的扩增效率高,内参的扩增效率低。在simple T 上有hindIII这个酶切位点吗,在map上没找到 啊。
        顺便问一下,在检测的时候,溶解曲线出现杂峰会对实验结果造成多大的影响?
拼搏定能成功
11楼2013-01-23 08:30:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 17 个回答

czfscf

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我觉得 可能是人品的问题 或者天气不好吧 哈哈  路过ing
Ecological Genomics;the scientific walking hormone
2楼2013-01-21 10:44:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yesali

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
是不是试剂出问题了,换换PCR mix试试
3楼2013-01-21 10:55:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
T-simple的EcoRV不是T接头的位置吗?如果克隆片段进去后就没有这个酶切位点了。
4楼2013-01-21 11:19:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
信息提示
请填处理意见