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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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swcjj

铁虫 (小有名气)

[求助] 序列分析和氨基酸功能预测 已有1人参与

求助:请问我有一段mRNA序列,怎么划分它的外显子区域,预测它的氨基酸功能域呢?急求!
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swcjj

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by diandong at 2013-01-17 16:36:45
http://smart.embl-heidelberg.de/smart/set_mode.cgi?NORMAL=1

有没有这个的教程?本人新手,非常感谢啊
5楼2013-01-17 16:51:55
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查看全部 8 个回答

yesali

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-01-22 12:02:13
先预测一下开放阅读框吧,可以用ORF finder
链接:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/orfig.cgi
2楼2013-01-17 15:55:24
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swcjj

铁虫 (小有名气)

我的这个序列已经是开放阅读框了,我想根据这个ORF序列得到这样的效果:
由几个外显子组成,在核苷酸水平上1-X位核苷酸为第1外显子,X位核苷酸为第2外显子,X位核苷酸为第3外显子......在氨基酸水平上X位氨基酸残基为信号肽,第X-X位为X 功能区,第X位X 功能区......
可以看明白吗?就是想得到类似这样的效果,谢谢
3楼2013-01-17 16:06:13
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diandong

禁虫 (著名写手)

感谢参与,应助指数 +1
本帖内容被屏蔽

4楼2013-01-17 16:36:45
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