24小时热门版块排行榜    

查看: 1821  |  回复: 7

swcjj

铁虫 (小有名气)

[求助] 序列分析和氨基酸功能预测 已有1人参与

求助:请问我有一段mRNA序列,怎么划分它的外显子区域,预测它的氨基酸功能域呢?急求!
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子生化实验经验积累

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yesali

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-01-22 12:02:13
先预测一下开放阅读框吧,可以用ORF finder
链接:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/orfig.cgi
2楼2013-01-17 15:55:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

swcjj

铁虫 (小有名气)

我的这个序列已经是开放阅读框了,我想根据这个ORF序列得到这样的效果:
由几个外显子组成,在核苷酸水平上1-X位核苷酸为第1外显子,X位核苷酸为第2外显子,X位核苷酸为第3外显子......在氨基酸水平上X位氨基酸残基为信号肽,第X-X位为X 功能区,第X位X 功能区......
可以看明白吗?就是想得到类似这样的效果,谢谢
3楼2013-01-17 16:06:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

diandong

禁虫 (著名写手)

感谢参与,应助指数 +1
本帖内容被屏蔽

4楼2013-01-17 16:36:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

swcjj

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by diandong at 2013-01-17 16:36:45
http://smart.embl-heidelberg.de/smart/set_mode.cgi?NORMAL=1

有没有这个的教程?本人新手,非常感谢啊
5楼2013-01-17 16:51:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

robertorun

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
用FGenesh,GenMarkHMM等预测基因的软件预测就是
6楼2013-01-19 09:36:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

swcjj

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by robertorun at 2013-01-19 09:36:52
用FGenesh,GenMarkHMM等预测基因的软件预测就是

哦,谢谢啊,我试试
7楼2013-01-22 09:56:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

虫子—zyq

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

内容已删除
8楼2016-03-27 18:12:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 学员KE4PcC 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 EWi2p09MOOv8 2026-08-16 6/300 2026-08-17 14:02 by EYK67XJMj64E
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +33 医学老男孩 2026-08-13 79/3950 2026-08-17 14:00 by GZUZM
[考博] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 6GojgJvkDudM 2026-08-16 4/200 2026-08-17 13:49 by EYK67XJMj64E
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +7 wangze12014 2026-08-14 8/400 2026-08-17 12:45 by a441914426
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +12 Ldrop2023 2026-08-13 13/650 2026-08-17 12:33 by gltch
[论文投稿] 岩土工程学报什么时候才能终审完呐 25+3 yeager111 2026-08-10 4/200 2026-08-16 20:42 by tfang
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 26/1300 2026-08-16 12:35 by 启萌科技
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +10 majunge000 2026-08-11 12/600 2026-08-16 08:18 by xli1984
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
信息提示
请填处理意见