24小时热门版块排行榜

>论坛更新日志 (1870)
>虫友互识 (84)
>导师招生 (31)
>论文投稿 (26)
>文献求助 (25)
>基金申请 (23)
>考研 (23)
>硕博家园 (21)
>考博 (21)
>公派出国 (21)
>找工作 (20)
>休闲灌水 (19)
>教师之家 (18)
>博后之家 (16)
>有机交流 (15)
>论文道贺祈福 (14)

返回列表

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

18988582

银虫 (正式写手)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 921.2
散金: 1037
红花: 2
帖子: 368
在线: 544.9小时
虫号: 1213821
注册: 2011-02-26
性别: GG
专业: 环境污染化学

[求助] 新手求助PCR产物Blast问题，先谢谢大家了

目的基因是HSP90
我在NCBI设计了一对引物，产物长度大概为300bp，但是跑出来的结果，电泳显示为500bp，拿去测序发现结果为500bp，在ncbi上进行比对，结果显示为下图，中间有一个GAP，求问为什么呢？

还有一个问题是正向测序和反向测序结果有什么区别，我两个方向都测了，结果不太一样啊！

反向测序结果.jpg

正向测序.jpg

回复此楼

» 猜你喜欢

坚持我的！

1楼 2013-01-12 16:01:51

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

18988582

银虫 (正式写手)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 921.2
散金: 1037
红花: 2
帖子: 368
在线: 544.9小时
虫号: 1213821
注册: 2011-02-26
性别: GG
专业: 环境污染化学

引用回帖:

11楼: Originally posted by wcg129 at 2013-01-14 08:56:34
模板是什么？DNA还是RNA？如果是DNA是否有内含子？

一般来说前面一段是你的目的基因，后面应该就是你的基因了，没见过前一段正常扩增，后一段非特异性扩增

用GAP设计引物验证，能扩出来说明就是你这个物种的 ...

恩，楼上说的很好！我的模板是DNA，设计引物的模板序列是转录组测序拼接得到的序列！谢谢，我再进一步验证一下！

会不会是拼接的问题呢？