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452201796

铁杆木虫 (小有名气)

[求助] 求助土壤宏基因组测序

想问站里有没有做过宏基因组测序的大虾?计划做土壤宏基因组测序,小弟刚接触,诸多问题不懂,尤其是测序深度/测序量如何确定,望赐教!
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oldflying

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amisking: 金币+3, 鼓励积极发帖帮助解答问题。 2013-01-06 19:48:22
452201796: 金币+3, ★★★很有帮助 2013-01-07 09:18:28
土壤宏基因组测序的研究好像不太多,建库筛选基因或活性物质的比较多。也有做其它环境测序的,如海洋、矿山废水等。你找这两篇文章看看吧:《Community structure and metabolism through reconstruction of microbial genomes from the environment》、《Environmental Genome Shotgun sequencing of The Sargasso Sea》,都是宏基因组测序的,应该可以参考一下。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

一个人的努力和坚持!
2楼2013-01-06 19:12:19
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452201796

铁杆木虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by oldflying at 2013-01-06 19:12:19
土壤宏基因组测序的研究好像不太多,建库筛选基因或活性物质的比较多。也有做其它环境测序的,如海洋、矿山废水等。你找这两篇文章看看吧:《Community structure and metabolism through reconstruction of microb ...

拜谢,望能多交流
stay hungry,stay foolish,stay young,stay alive
3楼2013-01-07 09:19:02
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vv588688

银虫 (小有名气)

请问取样可以取盆栽实验里面的吗?
comeon
4楼2018-05-10 21:51:55
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