24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 2324  |  回复: 31
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zhang860215

金虫 (正式写手)

[求助] 系统发育树构建

各位高人:
     本人鉴定出一株菌构建出的发育树想当不理想,不知是什么原因,能有那位高人帮我构建一下,主要是急需,来不急一点点找原因,先把结果弄好,我后面再学习,有能构建的我发相关序列给你,谢谢了!
回复此楼
幸福,就是找一个温暖的人过一辈子。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bupashibai

银虫 (小有名气)

引用回帖:
10楼: Originally posted by elbo at 2013-01-05 19:05:27
我是做多样性分析的,以下是我的个人建议,首先你要选择外群,这个外群你可以参考别人相似研究中的菌株,二 构建发育树的时候,所有序列方向要一致,就是你的序列和NCBI序列BLAST的时候,你看具体比对结果 QUery 和 ...

你好,我想问下比如我比对的是假单胞菌属,是不是建树要把假单胞菌各个种都包含上?除了这些,你说的外围群在么找,请不吝赐教,不胜感激
慢慢来。。。
32楼2013-09-09 10:30:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 32 个回答

cqlsf

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
现有的序列i是段 16s,还是什么?  考虑DNAMAN,ClustalX 试试
老顽虫是大酱油滴:知新,行知,业精于勤。。。木虫的闺蜜叫木马。。
2楼2013-01-04 20:25:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

joy_zuer

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你需要用什么方法或软件构建?mega行不行?
3楼2013-01-04 20:52:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhang860215

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by joy_zuer at 2013-01-04 20:52:51
你需要用什么方法或软件构建?mega行不行?

当然可以,我用的就是这个软件,希望您能帮到我
幸福,就是找一个温暖的人过一辈子。
4楼2013-01-05 09:47:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
信息提示
请填处理意见