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求助啊！！为什么amber最小化的时候没有rst输出文件，out文件也只有几行？
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求助啊！！为什么amber最小化的时候没有rst输出文件，out文件也只有几行？但是sander还是在跑的。。下面有out 文件。。 File Assignments: | MDIN: min1.in | MDOUT: min1.out |INPCRD: complex-wat.inpcrd | PARM: complex-wat.prmtop |RESTRT: min1.rst | REFC: complex-wat.inpcrd | MDVEL: mdvel | MDEN: mden | MDCRD: mdcrd |MDINFO: mdinfo |INPDIP: inpdip |RSTDIP: rstdip |INPTRA: inptraj | Here is the input file: stage1:fixed the protein &cntrl imin=1,ntb=1,cut=12, maxcyc=5000,ncyc=3000, ntr=1,restraint_wt=10, restraintmask=':1-239' / -------------------------------------------------------------------------------- 1. RESOURCE USE: -------------------------------------------------------------------------------- | Flags: getting new box info from bottom of inpcrd | INFO: Old style inpcrd file read | peek_ewald_inpcrd: Box info not found in inpcrd |Largest sphere to fit in unit cell has radius = 0.000 |
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2楼2013-01-10 18:17:22
yaozhq
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