24小时热门版块排行榜    

查看: 345  |  回复: 2

夏天的娃

金虫 (小有名气)

[求助] 两个片段对接几种不同构型优化出的能量差多少可认为是忽略呢(构型上不是差很远)

我想将两个片段对接,优化结构,在片段1同一个原子附近放置片段二,其中构型ABC相差很小,都是将片段2放在片段1上方,只是有所旋转,而D是将片段1与片段2的两个原子共面,是参照文献的构型建立的(文献未提供坐标)。优化后都无虚频,ABC除了保持一个基团旋转角度不同外,其它相差不远,而D与也基本保持它的初始构型,SCF能量结果如下表。在原excel里保留小数位数略多,能量相差比较明显,保留四位小数的是相差就很小了。在GV里明显这四个构型不是完全一样的,原子间距什么的都有点差别。
但是我很疑惑从这样的情况里应该怎样选其中一个构型呢?
换算成kJ/mol后,每个构型相差多少可以认为忽略不计呢?



问题有一点弱。。请求批评指正!

构型能量,及与最小小能量的差值
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gauss98

禁虫 (正式写手)

感谢参与,应助指数 +1
本帖内容被屏蔽

2楼2012-12-28 09:03:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

夏天的娃

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gauss98 at 2012-12-28 09:03:46
建议回小学重新学习语文

= =!没有表达清楚么?


就是:
判断稳定构型时,几种不同的构型能量相差多少可以忽略?
3楼2012-12-28 10:06:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 夏天的娃 的主题更新
信息提示
请填处理意见