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Fullprof 中键长限制
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使用Fullprof中的模拟退火模式simulated annealing 进行结构精修，需要约束键长。对话框中有CATOD1, CATOD2, ITnum, T1, T2, T3, Dist, Sigma的选填参数，帮助文件解释如下： CATOD1 and CATOD2: Names of the atoms to be constrained They must coincide with labels in the asymmetric unit. Rotation part： the rotation part of the symmetry operator to be applied to the coordinates of the atom CATOD2. (T1, T2, T3): Translation part of the above symmetry operator Dist : Value of the required distance. Sigma : Standard deviation of the distance. 请问T1, T2, T3,到底怎么用？有谁用过吗？  adfa.jpg |
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daxu
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7楼2012-12-28 20:57:24
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输出文件中有一个扩展名tpcr的文件，你需要的参数里边都有，其实自己编pcr文件很简单，首先dis要设置，譬如设置两个键长限制，dis设为2，三个键长限制就设置为3，然后下面要附上你贴的那些参数值。例如以dis=1为例限制白云石中C-O键的长度，具体如下 ! Soft distance constraints: C1 O1 26 0.00000 0.00000 0.00000 1.28500 0.00050 其实关键是itum值，我上面是以c-o键长为例来说明的，具体的要看你自己的结构。详细参数的意义可以看manual |
4楼2012-12-27 11:43:08
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daxu
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