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铜虫 (小有名气)

[求助] Fullprof 中键长限制

使用Fullprof中的模拟退火模式simulated annealing 进行结构精修,需要约束键长。对话框中有CATOD1, CATOD2, ITnum, T1, T2, T3, Dist, Sigma的选填参数,帮助文件解释如下:
CATOD1 and CATOD2: Names of the atoms to be constrained They must coincide with labels in the asymmetric unit.
Rotation part: the rotation part of the  symmetry operator to be applied to the coordinates of the atom CATOD2.
(T1, T2, T3): Translation part of the above symmetry operator
Dist : Value of the required distance.
Sigma : Standard deviation of the distance.
请问T1, T2, T3,到底怎么用?有谁用过吗?

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铜虫 (小有名气)

静候高人
2楼2012-12-26 10:30:44
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铜虫 (小有名气)

依然静候
3楼2012-12-27 08:59:58
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铜虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by daxu at 2012-12-27 11:43:08
输出文件中有一个扩展名tpcr的文件,你需要的参数里边都有,其实自己编pcr文件很简单,首先dis要设置,譬如设置两个键长限制,dis设为2,三个键长限制就设置为3,然后下面要附上你贴的那些参数值。例如以dis=1为例限 ...

说明看过,itum指原子2的对称性,即你的O原子的乌克夫对称性,对吧?那么为何不定义原子1的对称性呢?你的0.00000    0.00000    0.00000是怎么来的?
5楼2012-12-28 14:41:12
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铜虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by daxu at 2012-12-28 16:06:01
上贴中不是告诉你了,tpcr文件里都有,itum后边就是对称性,应该是关于两个原子之间的对称性,你限制原子的条件除了原子距离外肯定要考虑对称性啊。如果限制键角,有两个对称性,这个在tpcr文件中也可以看到...

不好意思,我有看到你提的tpcr,但我找了一圈也没找着能生成tpcr的参数,麻烦你把你的pcr 中  !Ipr Ppl Ioc Mat Pcr Ls1 Ls2 Ls3 NLI Prf Ins Rpa Sym Hkl Fou Sho Ana 这一行的参数告诉我吧
8楼2012-12-28 21:12:59
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