应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 已经得到一个距离矩阵，如何构建一个进化树。用PHYLIP的话，求详细步骤！
51/1返回列表
查看: 3666  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

凌风牧云

金虫 (小有名气)

[求助] 已经得到一个距离矩阵，如何构建一个进化树。用PHYLIP的话，求详细步骤！

已经得到一个距离矩阵，想要根据这个距离矩阵构建一个进化树。
用PHYLIP的话，求详细步骤！
如果用其它软件的话用什么比较好？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
等闲变却故人心，却道故人心易变
1楼 2012-12-24 09:38:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fanzhiquan

新虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 672418539 at 2015-12-22 21:37:54
楼主，我现在也在做这个问题，已经得到了距离矩阵，但是不知道格式方面有没有什么要求？我现在下载了MEGA软件，你用过吗？之后的步骤可不可以告诉我一下，我是一只新虫，求指教

问题解决了吗？怎么解决的呢？
赞一下 回复此楼
8楼2018-04-17 00:08:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

红太郎张玉

银虫 (小有名气)
我是用mega建树的。但是想问一下，你的问题解决了吗？我现在想用phylip建一颗有根的树，但是即使添加外类群依然提示说，是无根树。。。。
赞一下 回复此楼
2楼2013-11-06 08:28:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凌风牧云

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 红太郎张玉 at 2013-11-06 08:28:46
我是用mega建树的。但是想问一下，你的问题解决了吗？我现在想用phylip建一颗有根的树，但是即使添加外类群依然提示说，是无根树。。。。

解决了，
回复此楼
等闲变却故人心，却道故人心易变
3楼2013-11-06 13:47:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

红太郎张玉

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 凌风牧云 at 2013-11-06 13:47:41
解决了，...

麻烦问一下，你得到距离矩阵后，是如何聚类或者建树的，我是用unifrac得到矩阵后，不知道如何用phylip构建UPGMA聚类，急用，非常感谢
赞一下 回复此楼
4楼2013-11-06 21:56:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0856调剂，是学校就去 +8 sllhht 2026-03-19 9/450 2026-03-20 14:25 by 无懈可击111
[考研] 281求调剂（0805） +12 烟汐忆海 2026-03-16 23/1150 2026-03-20 12:50 by 功夫疯狂
[考研] 【考研调剂】化学专业 281分，一志愿四川大学，诚心求调剂 +6 吃吃吃才有意义 2026-03-19 6/300 2026-03-20 10:47 by 尽舜尧1
[考研] 304求调剂 +5 曼殊2266 2026-03-18 5/250 2026-03-20 09:00 by ZHANG0tao
[考研] 26调剂/材料/英一数二/总分289/已过A区线 +8 步川酷紫123 2026-03-13 8/400 2026-03-20 08:47 by xingguangj
[考研] 0817 化学工程 299分求调剂 有科研经历 有二区文章 +20 rare12345 2026-03-18 20/1000 2026-03-20 08:42 by 无际的草原
[考研] 一志愿中国海洋大学，生物学，301分，求调剂 +5 1孙悟空 2026-03-17 6/300 2026-03-19 23:46 by zcl123
[考研] 一志愿南京理工大学085701资源与环境302分求调剂 +3 葵梓卫队 2026-03-18 5/250 2026-03-19 19:35 by 给你你注意休息
[考研] 288求调剂，一志愿华南理工大学071005 +5 ioodiiij 2026-03-17 5/250 2026-03-19 18:22 by zcl123
[考博] 东华理工大学化材专业26届硕士博士申请 +8 zlingli 2026-03-13 8/400 2026-03-19 16:32 by 轻松不少随
[考研] 材料与化工求调剂 +7 为学666 2026-03-16 7/350 2026-03-19 14:48 by 尽舜尧1
[考研] 0703化学336分求调剂 +6 zbzihdhd 2026-03-15 7/350 2026-03-18 09:53 by zhukairuo
[考研] 环境工程调剂 +8 大可digkids 2026-03-16 8/400 2026-03-18 09:36 by zhukairuo
[论文投稿] 有没有大佬发小论文能带我个二作 +3 增锐漏人 2026-03-17 4/200 2026-03-17 09:26 by xs74101122
[考研] 药学383 求调剂 +3 药学chy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 20:51 by 元子^0^
[考研] 333求调剂 +3 文思客 2026-03-16 7/350 2026-03-16 18:21 by 文思客
[考研] 304求调剂 +5 素年祭语 2026-03-15 5/250 2026-03-16 17:00 by 我的船我的海
[考研] 304求调剂 +3 曼殊2266 2026-03-14 3/150 2026-03-16 16:39 by houyaoxu
[考研] 22408总分284求调剂 +3 InAspic 2026-03-13 3/150 2026-03-15 11:10 by zhq0425
[考研] 一志愿哈工大材料324分求调剂 +5 闫旭东 2026-03-14 5/250 2026-03-14 14:53 by 木瓜膏
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭