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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 已经得到一个距离矩阵，如何构建一个进化树。用PHYLIP的话，求详细步骤！
汕头大学海洋科学接受调剂
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凌风牧云

金虫 (小有名气)

[求助] 已经得到一个距离矩阵，如何构建一个进化树。用PHYLIP的话，求详细步骤！

已经得到一个距离矩阵，想要根据这个距离矩阵构建一个进化树。
用PHYLIP的话，求详细步骤！
如果用其它软件的话用什么比较好？
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等闲变却故人心，却道故人心易变
1楼 2012-12-24 09:38:03
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红太郎张玉

银虫 (小有名气)
我是用mega建树的。但是想问一下，你的问题解决了吗？我现在想用phylip建一颗有根的树，但是即使添加外类群依然提示说，是无根树。。。。
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2楼2013-11-06 08:28:46
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凌风牧云

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 红太郎张玉 at 2013-11-06 08:28:46
我是用mega建树的。但是想问一下，你的问题解决了吗？我现在想用phylip建一颗有根的树，但是即使添加外类群依然提示说，是无根树。。。。

解决了，
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等闲变却故人心，却道故人心易变
3楼2013-11-06 13:47:41
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红太郎张玉

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 凌风牧云 at 2013-11-06 13:47:41
解决了，...

麻烦问一下，你得到距离矩阵后，是如何聚类或者建树的，我是用unifrac得到矩阵后，不知道如何用phylip构建UPGMA聚类，急用，非常感谢
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4楼2013-11-06 21:56:37
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凌风牧云

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 红太郎张玉 at 2013-11-06 21:56:37
麻烦问一下，你得到距离矩阵后，是如何聚类或者建树的，我是用unifrac得到矩阵后，不知道如何用phylip构建UPGMA聚类，急用，非常感谢...

phylip的说明里有写，具体你再在论坛里找找看吧，我也说不太清楚
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等闲变却故人心，却道故人心易变
5楼2013-11-06 23:53:42
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红太郎张玉

银虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 凌风牧云 at 2013-11-06 23:53:42
phylip的说明里有写，具体你再在论坛里找找看吧，我也说不太清楚...

我看了说明了，中英问都看了。但是没发现有，因为现在就用，麻烦你了，帮帮忙，非常感谢，
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6楼2013-11-08 10:23:19
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672418539

新虫 (初入文坛)
楼主，我现在也在做这个问题，已经得到了距离矩阵，但是不知道格式方面有没有什么要求？我现在下载了MEGA软件，你用过吗？之后的步骤可不可以告诉我一下，我是一只新虫，求指教
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7楼2015-12-22 21:37:54
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fanzhiquan

新虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 672418539 at 2015-12-22 21:37:54
楼主，我现在也在做这个问题，已经得到了距离矩阵，但是不知道格式方面有没有什么要求？我现在下载了MEGA软件，你用过吗？之后的步骤可不可以告诉我一下，我是一只新虫，求指教

问题解决了吗？怎么解决的呢？
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8楼2018-04-17 00:08:43
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