应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 已经得到一个距离矩阵，如何构建一个进化树。用PHYLIP的话，求详细步骤！
51/1返回列表
查看: 3668  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

凌风牧云

金虫 (小有名气)

[求助] 已经得到一个距离矩阵，如何构建一个进化树。用PHYLIP的话，求详细步骤！

已经得到一个距离矩阵，想要根据这个距离矩阵构建一个进化树。
用PHYLIP的话，求详细步骤！
如果用其它软件的话用什么比较好？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
等闲变却故人心，却道故人心易变
1楼 2012-12-24 09:38:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

红太郎张玉

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 凌风牧云 at 2013-11-06 13:47:41
解决了，...

麻烦问一下，你得到距离矩阵后，是如何聚类或者建树的，我是用unifrac得到矩阵后，不知道如何用phylip构建UPGMA聚类，急用，非常感谢
赞一下 回复此楼
4楼2013-11-06 21:56:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

红太郎张玉

银虫 (小有名气)
我是用mega建树的。但是想问一下，你的问题解决了吗？我现在想用phylip建一颗有根的树，但是即使添加外类群依然提示说，是无根树。。。。
赞一下 回复此楼
2楼2013-11-06 08:28:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凌风牧云

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 红太郎张玉 at 2013-11-06 08:28:46
我是用mega建树的。但是想问一下，你的问题解决了吗？我现在想用phylip建一颗有根的树，但是即使添加外类群依然提示说，是无根树。。。。

解决了，
回复此楼
等闲变却故人心，却道故人心易变
3楼2013-11-06 13:47:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凌风牧云

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 红太郎张玉 at 2013-11-06 21:56:37
麻烦问一下，你得到距离矩阵后，是如何聚类或者建树的，我是用unifrac得到矩阵后，不知道如何用phylip构建UPGMA聚类，急用，非常感谢...

phylip的说明里有写，具体你再在论坛里找找看吧，我也说不太清楚
赞一下 回复此楼
等闲变却故人心，却道故人心易变
5楼2013-11-06 23:53:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 281求调剂（0805） +14 烟汐忆海 2026-03-16 25/1250 2026-03-20 15:47 by yuncha
[考研] 295材料求调剂，一志愿武汉理工085601专硕 +4 Charlieyq 2026-03-19 4/200 2026-03-20 14:26 by 无懈可击111
[考研] 0856调剂，是学校就去 +8 sllhht 2026-03-19 9/450 2026-03-20 14:25 by 无懈可击111
[考研] 求调剂 +4 Mqqqqqq 2026-03-19 4/200 2026-03-20 14:15 by 星空星月
[考研] 一志愿南昌大学，327分，材料与化工085600 +5 Ncdx123456 2026-03-19 5/250 2026-03-20 11:15 by wangy0907
[考研] 一志愿苏州大学材料求调剂，总分315（英一） +3 sbdksD 2026-03-19 3/150 2026-03-19 23:21 by fmesaito
[考研] 一志愿南京理工大学085701资源与环境302分求调剂 +3 葵梓卫队 2026-03-18 5/250 2026-03-19 19:35 by 给你你注意休息
[考博] 东华理工大学化材专业26届硕士博士申请 +8 zlingli 2026-03-13 8/400 2026-03-19 16:32 by 轻松不少随
[考研] 0703化学 305求调剂 +4 FY_yy 2026-03-14 4/200 2026-03-19 05:54 by anny19840123
[考研] 0703化学调剂，求各位老师收留 +10 秋有木北 2026-03-14 10/500 2026-03-19 05:52 by anny19840123
[考研] 材料工程专硕调剂 +5 204818@lcx 2026-03-17 6/300 2026-03-18 22:55 by 204818@lcx
[考研] 295求调剂 +3 一志愿京区211 2026-03-18 5/250 2026-03-18 17:03 by zhaoqian0518
[考研] 297求调剂 +8 戏精丹丹丹 2026-03-17 8/400 2026-03-18 14:30 by laoshidan
[考研] 301求调剂 +9 yy要上岸呀 2026-03-17 9/450 2026-03-18 08:58 by 无际的草原
[考研] 278求调剂 +5 烟火先于春 2026-03-17 5/250 2026-03-18 08:43 by 星空星月
[考研] 085601求调剂 +4 Du.11 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:08 by ruiyingmiao
[考研] 0854控制工程 359求调剂 可跨专业 +3 626776879 2026-03-14 9/450 2026-03-16 17:42 by 626776879
[考研] 304求调剂 +3 曼殊2266 2026-03-14 3/150 2026-03-16 16:39 by houyaoxu
[考研] 288求调剂 +4 奇点0314 2026-03-14 4/200 2026-03-14 23:04 by JourneyLucky
[考研] 复试调剂 +3 呼呼？~+123456 2026-03-14 3/150 2026-03-14 16:53 by WTUChen
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭