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质粒测序后发现有重叠现象
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Cllair
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质粒测序后发现有重叠现象
之前将克隆的基因直接送测序一直说有重叠现象得不到测序结果。上次将转化后的大肠杆菌提取质粒送测序,结果还是有重叠现象。。。有点濒临崩溃的边缘,十分想请教各位虫友,大家有没有遇到过类似的情况,怎么解决的啊。
还有就是我想着直接送转化后的大肠杆菌去测序,之前查过资料说菌样测序的话结果可能不如质粒好。。。能给点相关的建议不?
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1楼
2012-12-18 19:57:58
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8楼
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Originally posted by
liguanying
at 2012-12-19 18:50:22
如果用的通用引物测序,你向测序公司要一下,他们测序用的引物,然后和你的基因序列比对一下。看看是不是和你的基因序列有同源性。如果你用的是自己的基因引物测序,看一下你的引物是不是特异性不好。
我一直用自己的引物,我也觉得自己的引物特异性不够好,下次测序打算用通用引物。
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11楼
2012-12-20 09:30:50
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如果质粒没有提好会影响测序结果。首先确定一定要挑单克隆。有时候两个克隆靠在一起的不要用。筛到了阳性克隆,可以直接送菌液测序。
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2012-12-19 09:07:45
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2楼
:
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cicelyzh
at 2012-12-19 09:07:45
如果质粒没有提好会影响测序结果。首先确定一定要挑单克隆。有时候两个克隆靠在一起的不要用。筛到了阳性克隆,可以直接送菌液测序。
我这次把之前单克隆影印的菌落摇菌送测序的应该没问题吧?其实我一直都调单菌落的,这个基因自从在我师姐手里的时候就测序过很多次,一直因为重叠没有得到序列,我都开始怀疑这个基因本身有问题了。。。
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4楼
2012-12-19 11:11:58
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