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梦里晓诗

金虫 (小有名气)

[求助] 使用antechamber生成resp电荷时报错

请教各位大神,自学AMBER很抓狂啊。。。
想得到一个分子的resp电荷信息。之前用gaussian09先生成了*.log文件。输入文件为
hf/6-31g* SCA=tight Test Pop=MK iop(6/33=2) iop(6/42=6)
使用AMBER进行转化的时候报错,输入命令为
/antechamber -i *.log -fi gout -o *.mol2 -fo mol2 -c resp

出错信息如下
Info: Bond types are assigned for valence state 1 with penalty of 1


Info: the number of the ESP exceeds the MAXESP(20000),extend the size and reallocate the memory automatically



Amber 9 RESP


  Unit   10 Error on OPEN: ANTECHAMBER.ESP
Error: cannot run "resp -O -i ANTECHAMBER_RESP1.IN -o ANTECHAMBER_RESP1.OUT -e ANTECHAMBER.ESP -t qout" in resp() of charge.c properly, exit




另外,很想求助、我的体系有四、五十个原子,请问用resp电荷计算和bcc电荷计算差别有多大呢?因为一直resp电荷一直转化不出来,而bcc电荷可以得到。如果区别不是很大的话,就直接用bcc电荷算了。。折腾的我快折寿了。。。。
跪求指导。。。。

[ Last edited by 梦里晓诗 on 2012-12-17 at 16:31 ]
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梦里晓诗

金虫 (小有名气)

谢谢各位的指导,我问过了导师,发现是gaussian09的b版本在计算resp电荷方面有个小的bug,如果用a或者c版本算就不会出现这个问题了。

我的问题已经解决,如果有人遇到同样的问题,希望我的境况可以给予帮助。
6楼2012-12-20 14:24:50
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查看全部 7 个回答

caixin5120

木虫 (正式写手)


【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
梦里晓诗: 金币+1, 谢谢啊,但是我的体系是中性的,而且没有重原子,都是C、H、O、N 2012-12-17 16:58:03
可以参考一下这篇帖子 http://www.bioms.org/thread-125-1-2.html
2楼2012-12-17 16:51:46
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ina_bo

新虫 (初入文坛)

顶一个,沉的好快
3楼2012-12-17 21:47:06
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ina_bo

新虫 (初入文坛)

如果用gaussian计算了那就不知道是什么的问题了。。。。
4楼2012-12-17 21:50:05
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