| 查看: 1470 | 回复: 4 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
grompp出错
|
||
|
求助求助 本人新手，在做分子动力学模拟，进行到grompp这步一直出错，错误如下： Program grompp, VERSION 4.5.1 Source code file: toppush.c, line: 1228 Fatal error: moleculetype ABC is redefined For more information and tips for troubleshooting, please check the GROMACS website at http://www.gromacs.org/Documentation/Errors 不知道改怎么解决，求大神指导！！ PS:所用文件在附件中 |
回复此楼» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : test1.rar
2012-12-14 12:18:16, 532.54 K
» 猜你喜欢
各位大神，目前国内有哪些比较好用的逆合成软件？
已经有14人回复
-
国社科系统bug了，是不是要放榜了？
已经有10人回复
-
现代”学阀”该如何界定
已经有9人回复
-
课题组招2027级博士 上海工程技术大学 激光智能制造方向
已经有4人回复
-
上海工程技术大学 激光智能制造课题组 2027级博士研究生招生
已经有3人回复
-
上海工程技术大学激光智能制造课题组｜2027级博士研究生招生公告
已经有11人回复
-
申博发邮件
已经有11人回复
-
我的奶奶
已经有3人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
5楼2012-12-17 16:07:25
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+10, 谢谢 2012-12-17 13:24:41
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+10, 谢谢 2012-12-17 13:24:41
|
1、提示里面的“moleculetype ABC is redefined”很好理解吧？ 就是说你的分子ABC 被重新定义了，查一个google翻译也很好理解对吧？ 那这时候就需要看你的拓扑文件里关于ABC定义的部分了啊？ 果然在你的trp.top文件里面“ ; Include forcefield parameters #include "gromos43a2.ff/forcefield.itp" ;include ligand topology #include "drg.itp" [ moleculetype ] ; Name nrexcl ABC 3 ” 这段内容你需要好好理解一下，问题就出在这儿！ 加一个标点符号就能解决问题了 或者删掉一段内容也没问题了，自己理解吧！ 2、个人建议，最好别上传附件，挺麻烦的，最好把遇到的问题贴在帖子里，一目了然！ |
2楼2012-12-14 14:32:37
3楼2012-12-16 17:21:40
4楼2012-12-16 19:31:11