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[求助]
grompp出错
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求助求助 本人新手，在做分子动力学模拟，进行到grompp这步一直出错，错误如下： Program grompp, VERSION 4.5.1 Source code file: toppush.c, line: 1228 Fatal error: moleculetype ABC is redefined For more information and tips for troubleshooting, please check the GROMACS website at http://www.gromacs.org/Documentation/Errors 不知道改怎么解决，求大神指导！！ PS:所用文件在附件中 |
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2012-12-14 12:18:16, 532.54 K
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3楼2012-12-16 17:21:40
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+10, 谢谢 2012-12-17 13:24:41
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+10, 谢谢 2012-12-17 13:24:41
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1、提示里面的“moleculetype ABC is redefined”很好理解吧？ 就是说你的分子ABC 被重新定义了，查一个google翻译也很好理解对吧？ 那这时候就需要看你的拓扑文件里关于ABC定义的部分了啊？ 果然在你的trp.top文件里面“ ; Include forcefield parameters #include "gromos43a2.ff/forcefield.itp" ;include ligand topology #include "drg.itp" [ moleculetype ] ; Name nrexcl ABC 3 ” 这段内容你需要好好理解一下，问题就出在这儿！ 加一个标点符号就能解决问题了 或者删掉一段内容也没问题了，自己理解吧！ 2、个人建议，最好别上传附件，挺麻烦的，最好把遇到的问题贴在帖子里，一目了然！ |
2楼2012-12-14 14:32:37
4楼2012-12-16 19:31:11
5楼2012-12-17 16:07:25